76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0578 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 425 aa  805    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  32.14 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  28.86 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 409 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  30.65 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 417 aa  96.3  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  32.51 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  26.8 
 
 		 407 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 448 aa  91.3  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  25.25 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 454 aa  87.4  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  29.73 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  28.19 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  31.37 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  33.92 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  30.48 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  30.65 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 402 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  29.94 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  27.98 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  28.93 
 
 		 453 aa  53.1  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 424 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  21.67 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 		 1019 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  27.95 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  25.06 
 
 		 437 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  27.67 
 
 		 467 aa  43.5  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 429 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  26.01 
 
 		 424 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>