76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28500 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 
437 aa  823    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  59.38 
 
 
413 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  54.92 
 
 
472 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 
424 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  46.85 
 
 
453 aa  294  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  37.91 
 
 
482 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 
452 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  32.41 
 
 
409 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 
446 aa  111  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
409 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
404 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  25.83 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
399 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  28.61 
 
 
420 aa  93.6  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 
448 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 
417 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
402 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  25.82 
 
 
410 aa  90.1  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  26.5 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  26.97 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
417 aa  86.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  28.88 
 
 
396 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  28.85 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 
409 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  26.05 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  28.65 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  25.39 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  27.39 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  27.49 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  28.12 
 
 
464 aa  67  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 
454 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  28.04 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
414 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  26.52 
 
 
419 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  27.45 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  27.56 
 
 
390 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  27.78 
 
 
413 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  26.15 
 
 
393 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  27.33 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  27.62 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  27.61 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
432 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 
430 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
399 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  22.07 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  26.69 
 
 
469 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  28.72 
 
 
405 aa  50.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 
405 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  39.37 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
407 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  30 
 
 
430 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  27.98 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  28.81 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  24.45 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  28.23 
 
 
415 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  27.92 
 
 
436 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 
413 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
449 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  27.05 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
397 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  37.01 
 
 
421 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
407 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 
439 aa  43.5  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
390 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  24.25 
 
 
417 aa  43.5  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
428 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 
403 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144335 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>