83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2693 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  100 
 
 
398 aa  773    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  71.17 
 
 
402 aa  521  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  67.68 
 
 
402 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  68.73 
 
 
402 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  68.73 
 
 
402 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  64.38 
 
 
430 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  65.12 
 
 
404 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  47.77 
 
 
407 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  52.2 
 
 
417 aa  360  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  56.19 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  51.5 
 
 
401 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  51.5 
 
 
401 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  55.03 
 
 
406 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  46.17 
 
 
410 aa  329  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  46.74 
 
 
403 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  45.55 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  44.17 
 
 
408 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 
409 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  49.34 
 
 
414 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  38.68 
 
 
420 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 
417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 
446 aa  242  7.999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 
448 aa  239  8e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 
409 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  39.08 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  40.92 
 
 
396 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 
399 aa  212  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  36.65 
 
 
409 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  38.59 
 
 
396 aa  212  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
402 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
454 aa  192  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  34.6 
 
 
408 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 
404 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 
403 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 
407 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  28.46 
 
 
439 aa  142  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  33.96 
 
 
405 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  23.16 
 
 
464 aa  113  5e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  29.63 
 
 
393 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 
430 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  30.55 
 
 
395 aa  106  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  29.89 
 
 
419 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  31.99 
 
 
417 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
432 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 
399 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
412 aa  99.8  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
396 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
420 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  29.92 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  30.57 
 
 
481 aa  86.7  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  29.97 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  29.29 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  28.36 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
439 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
405 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  28.18 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 
424 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 
430 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  26.85 
 
 
453 aa  63.5  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  26.03 
 
 
410 aa  63.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  27.39 
 
 
408 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  37.82 
 
 
433 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  28.06 
 
 
437 aa  60.1  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 
1019 aa  60.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
449 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 
388 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
452 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  27.1 
 
 
394 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 
392 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  28.25 
 
 
482 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  29.11 
 
 
467 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  26.27 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  27.9 
 
 
420 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
413 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1971  hypothetical protein  28.57 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  25 
 
 
472 aa  43.5  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>