80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1865 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  98.76 
 
 		 402 aa  769    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  776    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  74.74 
 
 		 402 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  72.64 
 
 		 402 aa  542  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  75.06 
 
 		 430 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  67.53 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  67.75 
 
 		 404 aa  418  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  52.67 
 
 		 407 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  60.2 
 
 		 390 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  56.1 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  55.22 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  52.21 
 
 		 401 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  52.47 
 
 		 401 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  52.53 
 
 		 409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  54.59 
 
 		 414 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  46.82 
 
 		 403 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 405 aa  315  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  45.88 
 
 		 410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  47 
 
 		 408 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 		 417 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  37.16 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  39.59 
 
 		 420 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 446 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  37.63 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 409 aa  216  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 402 aa  209  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 448 aa  206  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 		 407 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 454 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  27.59 
 
 		 439 aa  139  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  26.41 
 
 		 464 aa  130  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  33.78 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  30.42 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 399 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  30.59 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  33.25 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 396 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 405 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 412 aa  93.2  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 412 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 417 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  28.1 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  29.89 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 1019 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  27.91 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  27.51 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  25.89 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  29.67 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  24.11 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  25.89 
 
 		 472 aa  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  30.29 
 
 		 467 aa  46.6  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  23.53 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>