70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2605 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  781    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  31.45 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 404 aa  133  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  33.42 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 448 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 399 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  29.22 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  34.42 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  26.4 
 
 		 407 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  31.2 
 
 		 409 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  29.27 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  28.97 
 
 		 401 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 398 aa  93.6  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  24.83 
 
 		 464 aa  92.8  9e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  30.85 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  31.31 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  29.48 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  32.02 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  29.39 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  36.93 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  33.98 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  27.62 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  29.7 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 449 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 482 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 417 aa  53.5  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  29.2 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 439 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>