79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13000 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 453 aa  865    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  51.86 
 
 		 472 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  46.85 
 
 		 437 aa  320  5e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  49.63 
 
 		 413 aa  303  6.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  44.85 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 420 aa  169  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  30.18 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  30.5 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  27.78 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 409 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 404 aa  96.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 414 aa  96.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  25.38 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  28.32 
 
 		 401 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 446 aa  93.6  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  29 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 403 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 402 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  25.55 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  32.9 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  28.65 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  25 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  29.58 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  27.74 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 449 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  31.45 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  33.89 
 
 		 405 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  34.42 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 407 aa  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 406 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  28.51 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 388 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  19.23 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  25.23 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 396 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  30.63 
 
 		 467 aa  43.9  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  19.21 
 
 		 408 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 427 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  19.21 
 
 		 408 aa  43.5  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>