80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2846 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  100 
 
 
410 aa  794    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  76.96 
 
 
405 aa  581  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  74.56 
 
 
408 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  46.87 
 
 
407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 
402 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  50.26 
 
 
401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  50 
 
 
401 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  45.09 
 
 
402 aa  315  7e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  46.24 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  49.47 
 
 
390 aa  296  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 
417 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  40.82 
 
 
403 aa  288  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  43.4 
 
 
430 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 
404 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
409 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  45.97 
 
 
402 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  45.7 
 
 
402 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  43.41 
 
 
406 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  44.32 
 
 
414 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 
409 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 
417 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 
414 aa  243  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 
399 aa  242  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 
446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  38.56 
 
 
420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  37.17 
 
 
396 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  35.5 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 
448 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 
402 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  36.34 
 
 
396 aa  196  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 
404 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 
454 aa  183  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 
403 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  29.26 
 
 
408 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 
407 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  28.26 
 
 
439 aa  142  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  33.69 
 
 
405 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  26.41 
 
 
464 aa  129  7.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  29.55 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
396 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
412 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 
424 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  29.68 
 
 
417 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
432 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  29.61 
 
 
419 aa  100  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 
420 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
413 aa  93.6  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
439 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  29.44 
 
 
481 aa  86.7  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  29.19 
 
 
453 aa  86.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  25.82 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  25.75 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  27.39 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  26.84 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  24.18 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  24.58 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
427 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  25.09 
 
 
469 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  26.77 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
452 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  25.07 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  25.07 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 
1019 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  27.39 
 
 
408 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  32.05 
 
 
482 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 
449 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  27.6 
 
 
449 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  25.46 
 
 
420 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 
420 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 
388 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>