96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3030 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  801    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  34.09 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  30.85 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  33.25 
 
 		 396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 414 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 417 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  33.67 
 
 		 420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 410 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  34.86 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 398 aa  169  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  31.2 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  30.43 
 
 		 401 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 403 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 404 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  28.33 
 
 		 439 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  26.44 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 425 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  29.55 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  26.76 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  28.46 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  28.19 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  28.42 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  26.25 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  28.48 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  26.97 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 1019 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  26.86 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  24.51 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  28.65 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  26.68 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 469 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  25.42 
 
 		 467 aa  50.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  21.99 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  25.85 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0647  hypothetical protein  24.6 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  26.55 
 
 		 424 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  26.55 
 
 		 424 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 413 aa  46.6  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  21.78 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  22.49 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>