77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0953 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  877    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  56.68 
 
 		 464 aa  527  1e-148  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 		 414 aa  240  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  37.64 
 
 		 420 aa  239  6.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 409 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 417 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  34.35 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  29.29 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  30.33 
 
 		 409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  31.75 
 
 		 403 aa  163  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 417 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  30.15 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  29.66 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 396 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  29 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  25.55 
 
 		 481 aa  133  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 408 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 404 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 406 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 404 aa  118  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  26.13 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  26.17 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  25.39 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  28.84 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  24.69 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  22.89 
 
 		 1019 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  26.13 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  23.54 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  25.12 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  22.63 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 469 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  24.31 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  24.63 
 
 		 408 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 407 aa  49.7  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>