77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2303 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  100 
 
 		 409 aa  788    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  61.17 
 
 		 396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  53.13 
 
 		 402 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  46.09 
 
 		 409 aa  293  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  44.86 
 
 		 420 aa  287  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  43.36 
 
 		 446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  40.55 
 
 		 401 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  40.05 
 
 		 401 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  38.54 
 
 		 407 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 448 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  40.32 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 417 aa  246  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 417 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 408 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 403 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 398 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 402 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 390 aa  202  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  40.15 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 430 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 408 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 404 aa  176  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  30.4 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  28.61 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 407 aa  152  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  35.97 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 432 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  30.2 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 417 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  31.27 
 
 		 453 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 420 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  30.1 
 
 		 472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  30.34 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 425 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  32.41 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  33.96 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  34.27 
 
 		 481 aa  100  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  31.36 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 482 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 449 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 1019 aa  60.1  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  26.77 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  30.9 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  31.22 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>