63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2572 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  100 
 
 		 482 aa  911    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  66.9 
 
 		 452 aa  355  8.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  39.68 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  38.41 
 
 		 437 aa  197  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 424 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  38.55 
 
 		 453 aa  167  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  37.19 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  32.41 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 409 aa  110  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  29.81 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  26.15 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 404 aa  97.1  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 		 403 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 399 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 454 aa  90.1  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 405 aa  90.1  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  27.33 
 
 		 420 aa  87  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 402 aa  87  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  28.67 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  28.44 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  34.51 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  29.19 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 402 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  28.68 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 402 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 390 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  24.63 
 
 		 439 aa  67  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  23.38 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 399 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 417 aa  53.9  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  37.82 
 
 		 417 aa  50.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 405 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 407 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 393 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 402 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  35.48 
 
 		 471 aa  47  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  27.4 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>