102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0458 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  100 
 
 
397 aa  751    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
414 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  30.21 
 
 
403 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 
417 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  29.77 
 
 
420 aa  122  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  30.83 
 
 
417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  24.6 
 
 
407 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  30.92 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  32.97 
 
 
395 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
448 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
409 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  30.83 
 
 
404 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  33.7 
 
 
397 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 
399 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  29.07 
 
 
390 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 
1019 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
402 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
430 aa  99.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  30.61 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  34.41 
 
 
407 aa  97.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  33.07 
 
 
396 aa  96.3  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
427 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  30.91 
 
 
430 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
392 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
449 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  30.26 
 
 
410 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
417 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
399 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  28.73 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  28 
 
 
396 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  30.38 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 
402 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  28.9 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  29.76 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  29.81 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  28.01 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  30.08 
 
 
419 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  24.05 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  30.73 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  30.68 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  25.24 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  25.12 
 
 
439 aa  73.6  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  29.5 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  31.79 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  29.13 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  25.07 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  21.36 
 
 
481 aa  66.6  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  26.99 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  26.99 
 
 
402 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
430 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  28.57 
 
 
472 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
407 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  27.25 
 
 
453 aa  56.6  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  27.99 
 
 
424 aa  56.2  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
392 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
408 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  27.51 
 
 
465 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 
408 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  30 
 
 
405 aa  50.1  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  28.73 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  27.79 
 
 
465 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  33.06 
 
 
437 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
400 aa  47  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  27.84 
 
 
469 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  28.14 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  29.79 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  31.58 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  29.11 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  33.93 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  33.33 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  24.55 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  33.93 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  29.19 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2119  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.15 
 
 
526 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.15 
 
 
526 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.65 
 
 
409 aa  43.5  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 
412 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>