79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3286 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  824    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  73.59 
 
 		 402 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  73.15 
 
 		 402 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  74.94 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  75.06 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  72.24 
 
 		 404 aa  428  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  64.38 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  61.28 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  48.17 
 
 		 407 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  56.45 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  52.36 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  55.74 
 
 		 414 aa  339  7e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  52.42 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  52.42 
 
 		 401 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  47.21 
 
 		 403 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  51.51 
 
 		 409 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 410 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  44.3 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 		 408 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  42.63 
 
 		 399 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  38.9 
 
 		 420 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  39.43 
 
 		 396 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 414 aa  233  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 448 aa  222  9e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 		 402 aa  216  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  37.56 
 
 		 409 aa  209  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  37.85 
 
 		 454 aa  195  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  37.19 
 
 		 403 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 		 407 aa  176  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  28.9 
 
 		 439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  36.27 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  25.81 
 
 		 464 aa  123  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  31.31 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  30.64 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  30.93 
 
 		 417 aa  96.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  28.43 
 
 		 481 aa  89.7  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 399 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 427 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  31.35 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  29.64 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 1019 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  29.61 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  27.65 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  26.39 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  25.61 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 482 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  26.1 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  30 
 
 		 467 aa  50.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>