81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7368 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 399 aa  782    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  41.9 
 
 		 407 aa  316  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  41.65 
 
 		 401 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  42.39 
 
 		 401 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  45.74 
 
 		 396 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 409 aa  268  8.999999999999999e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 446 aa  266  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  40.76 
 
 		 420 aa  264  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  41.02 
 
 		 414 aa  259  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 		 417 aa  260  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 410 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 		 402 aa  255  9e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 403 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 408 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 		 404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 		 409 aa  242  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  41.95 
 
 		 402 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  42.97 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 		 402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  38.89 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 448 aa  233  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 430 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 404 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  39.17 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 406 aa  217  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  39.17 
 
 		 402 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  38.32 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 408 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  42.06 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  32.09 
 
 		 439 aa  162  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  34.05 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 399 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 424 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  28.64 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  28.72 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  34.88 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  27.99 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 432 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  27.15 
 
 		 437 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 452 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  29.89 
 
 		 481 aa  94.4  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 396 aa  93.2  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  27.54 
 
 		 472 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 413 aa  86.7  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 427 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  26.43 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  27.38 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 		 1019 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 482 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  23.01 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  26.5 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  24.27 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 430 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1971  hypothetical protein  35.16 
 
 		 387 aa  49.7  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  31.4 
 
 		 467 aa  47.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>