79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1842 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  100 
 
 		 390 aa  761    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  61.73 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  60.71 
 
 		 402 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  51.79 
 
 		 407 aa  408  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  57.44 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  62.16 
 
 		 402 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  61.62 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  55.01 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  62.16 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  61.38 
 
 		 404 aa  381  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  54.5 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  57.3 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  56.27 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  51.2 
 
 		 403 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  50.4 
 
 		 405 aa  346  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  51.93 
 
 		 409 aa  341  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  49.47 
 
 		 410 aa  335  9e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  53.66 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  47.62 
 
 		 408 aa  319  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  43.9 
 
 		 399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  43.34 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  41.58 
 
 		 420 aa  263  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  39.63 
 
 		 417 aa  259  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  43.32 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 446 aa  242  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  39.02 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 408 aa  176  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  30.1 
 
 		 439 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  35.05 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  26.12 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  43.15 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  25.89 
 
 		 481 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  30.1 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  30.73 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  29.41 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 439 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  29.97 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 412 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 413 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 399 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  27.99 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  27.56 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  26.26 
 
 		 1019 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  23.26 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  25.72 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  28.69 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 482 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  26.37 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>