80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2972 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  97.51 
 
 
401 aa  727    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  775    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  57.46 
 
 
407 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  57.92 
 
 
402 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  55 
 
 
417 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  55.32 
 
 
402 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  50 
 
 
410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  49.88 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  48.88 
 
 
408 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  47.85 
 
 
403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  54.5 
 
 
390 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  51.5 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  52.43 
 
 
402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  52.43 
 
 
402 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  50.12 
 
 
406 aa  317  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  52.56 
 
 
414 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  54.71 
 
 
404 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  52.7 
 
 
430 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  42.09 
 
 
399 aa  279  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  40.05 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  39.9 
 
 
420 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 
446 aa  266  5.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 
448 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  40.77 
 
 
396 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 
409 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  41.24 
 
 
414 aa  257  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  42.51 
 
 
396 aa  232  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 
402 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 
404 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  31.32 
 
 
408 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  35.03 
 
 
403 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  30.15 
 
 
439 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 
407 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  35.6 
 
 
405 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  25.99 
 
 
464 aa  143  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  44.16 
 
 
454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  30.13 
 
 
419 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  29.59 
 
 
393 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  29.83 
 
 
453 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
424 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
420 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
396 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 
399 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  32.37 
 
 
481 aa  93.2  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 
417 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  27.48 
 
 
395 aa  90.1  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
432 aa  89.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  31.35 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 
405 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  28.75 
 
 
404 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  27.39 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  27.39 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
425 aa  72.8  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  28.23 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  29.02 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 
1019 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 
452 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  24.61 
 
 
472 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  29 
 
 
482 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  27.36 
 
 
397 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
413 aa  59.7  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  27.61 
 
 
410 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  26.68 
 
 
420 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
430 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  31.08 
 
 
469 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  30.73 
 
 
467 aa  50.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.2 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  27.6 
 
 
450 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  25.08 
 
 
414 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>