76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3935 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  730    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 		 417 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  36.52 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 446 aa  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  27.94 
 
 		 407 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  33.73 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 412 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 399 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  37.13 
 
 		 407 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 407 aa  99.8  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 405 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 406 aa  96.3  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  30.79 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 403 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  31.27 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  31.47 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  31.47 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  29.69 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  26.02 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  35.6 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  32 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  30.41 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  33.33 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  30.17 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 1019 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  31.37 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  28.28 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 400 aa  53.1  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 454 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  31.32 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 452 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  31.05 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3045  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>