85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 420 aa  822    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  59.02 
 
 		 448 aa  485  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  61.06 
 
 		 414 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  61.77 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  47.24 
 
 		 454 aa  340  4e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  44.86 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  44.5 
 
 		 396 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  37.44 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  41.85 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 		 417 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  41.04 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  39.9 
 
 		 401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  39.45 
 
 		 402 aa  257  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 		 399 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  38.25 
 
 		 417 aa  249  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  37.64 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 410 aa  237  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 408 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  40.4 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 409 aa  222  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  33.87 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 		 404 aa  221  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 		 407 aa  209  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 408 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  31.21 
 
 		 481 aa  177  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  36.1 
 
 		 405 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  31 
 
 		 419 aa  140  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  30.56 
 
 		 407 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 397 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 399 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 393 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  30.4 
 
 		 417 aa  96.3  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  28.08 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  29.13 
 
 		 437 aa  89.7  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  28.25 
 
 		 453 aa  89.7  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 		 1019 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  26.68 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  27.93 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  27.67 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  27.66 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 388 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  27.98 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1971  hypothetical protein  30.23 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27300  Na+/melibiose symporter-like transporter  26.98 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566046  normal  0.31967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>