68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0745 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 400 aa  729    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  35.97 
 
 		 472 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  36.18 
 
 		 437 aa  155  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  37.33 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 424 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  31.13 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  32.18 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  33.43 
 
 		 409 aa  113  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 410 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 448 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  35 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 417 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  27.67 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 409 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  31.28 
 
 		 401 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 390 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  30.39 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 404 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  33.15 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  33.06 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 430 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 432 aa  86.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  30.27 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  27.36 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 469 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  30.11 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  28.84 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  27.45 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  35.5 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 396 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 397 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 449 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>