81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0686 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  791    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 414 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  36.63 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 399 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  41.2 
 
 		 446 aa  262  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  40.9 
 
 		 420 aa  260  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  41.02 
 
 		 417 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 402 aa  257  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  43.26 
 
 		 396 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  41.4 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  40.9 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 410 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  40.2 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 		 408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 406 aa  240  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 403 aa  235  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 448 aa  226  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 396 aa  226  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 430 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 398 aa  219  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  42.22 
 
 		 403 aa  216  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 454 aa  209  8e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 404 aa  206  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 		 404 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  38.57 
 
 		 414 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  31.92 
 
 		 439 aa  169  8e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 		 407 aa  167  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  30.05 
 
 		 464 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  34.46 
 
 		 405 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 413 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 397 aa  102  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  28.18 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  29.46 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  29.13 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  28.8 
 
 		 481 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 439 aa  94.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  26.26 
 
 		 437 aa  87  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 413 aa  86.7  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  27.62 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  26.9 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 407 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  26.97 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  26.36 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  26.91 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 1019 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  27.98 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 469 aa  53.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  43.84 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29400  A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  33.78 
 
 		 549 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  27.96 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>