65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36350 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 420 aa  815    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  45.13 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 397 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  41.98 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 449 aa  236  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 1019 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 388 aa  216  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  41.11 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  35.38 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 446 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  27.64 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  27.8 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  31.83 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  29.34 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  29.11 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  28.42 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 432 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 430 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  27.49 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  27.21 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  28.63 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 454 aa  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  25.66 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  25 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  28.53 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  31.93 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>