78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1475 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  838    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  82.34 
 
 		 430 aa  610  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  50.43 
 
 		 467 aa  385  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 413 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 397 aa  249  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  38.19 
 
 		 410 aa  212  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 1019 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 388 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 		 392 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  37.44 
 
 		 408 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  32.72 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  27.82 
 
 		 420 aa  103  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 397 aa  90.5  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  29.16 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  26.02 
 
 		 439 aa  86.3  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  23.74 
 
 		 481 aa  82.4  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  25.17 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  26.53 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  24.54 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  26.19 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  26.46 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  26.67 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  27.67 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  31.36 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  31.36 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  31.36 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  31.36 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  30 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  29.17 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  22.98 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  30.33 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  29.66 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  29.17 
 
 		 399 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  29.66 
 
 		 381 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  34.17 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  34.17 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  34.17 
 
 		 400 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  34.17 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  34.75 
 
 		 505 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  34.75 
 
 		 506 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  34.75 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  34.17 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  34.17 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>