115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1580 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 444 aa  840    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  47.28 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 421 aa  256  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  43.3 
 
 		 420 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 		 427 aa  249  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  50.14 
 
 		 422 aa  249  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  44.66 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  43.58 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  40.94 
 
 		 432 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  40.1 
 
 		 426 aa  216  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 		 427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1387  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 448 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 		 441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  42.34 
 
 		 433 aa  196  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  34.76 
 
 		 424 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  38.71 
 
 		 436 aa  186  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1423  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 491 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.992292  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  35.43 
 
 		 409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 422 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  35.26 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  35.34 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  35.34 
 
 		 424 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  35.01 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  36.27 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 405 aa  117  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 444 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 398 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 397 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  28.69 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  26.63 
 
 		 422 aa  99.8  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 397 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 409 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 418 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  28.02 
 
 		 409 aa  90.9  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  24.51 
 
 		 375 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 406 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  25.91 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  28.46 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  24.72 
 
 		 393 aa  87.4  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  25.82 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  24.38 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  27.23 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  26.8 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  25.07 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  27.07 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  27.05 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  25.5 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  29.02 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  26.62 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  31.89 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  27.07 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  29.14 
 
 		 389 aa  57  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  25.37 
 
 		 465 aa  57  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  28.53 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0143  hypothetical protein  39.06 
 
 		 156 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1295  multidrug transporter  34.78 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>