More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3783 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3783  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 
405 aa  829    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4079  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  52.65 
 
 
405 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23084  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0329  putative ABC transport protein substrate-binding component  53.65 
 
 
405 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42175  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7057  Extracellular ligand-binding receptor  50.12 
 
 
420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3421  ABC transporter substrate-binding protein  48.49 
 
 
406 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6250  ABC transporter substrate-binding protein  51.47 
 
 
413 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3891  extracellular ligand-binding receptor  50.27 
 
 
406 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0709  Leu/Ile/Val-binding family protein  50.4 
 
 
406 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6215  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  52.82 
 
 
403 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1152  UreA/short-chain amide ABC transporter  48.45 
 
 
415 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1640  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  49.33 
 
 
412 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000640664  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1790  Leu/Ile/Val-binding family protein  50.13 
 
 
417 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3887  ureA/short-chain amide ABC transporter  48.53 
 
 
413 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2487  Extracellular ligand-binding receptor  47.78 
 
 
404 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5300  putative periplasmic substrate binding protein  50.53 
 
 
397 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1254  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  48.68 
 
 
427 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5091  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  48.79 
 
 
416 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339692  normal  0.603773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0182  extracellular ligand-binding receptor  47.85 
 
 
413 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4932  extracellular ligand-binding receptor  50.4 
 
 
409 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3199  extracellular ligand-binding receptor  46.75 
 
 
405 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2864  putative periplasmic binding ABC transporter protein  49.37 
 
 
401 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1377  ABC transporter substrate-binding protein  47.77 
 
 
404 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3279  Extracellular ligand-binding receptor  49.6 
 
 
400 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0682  putative branched chain amino acid binding protein  50.26 
 
 
395 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246685  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2256  extracellular ligand-binding receptor  47.52 
 
 
403 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.777349  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1674  ABC transporter substrate-binding protein  49.75 
 
 
409 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3757  ABC transporter substrate-binding protein  46.42 
 
 
409 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3303  amide-urea binding protein  48.39 
 
 
404 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3122  Extracellular ligand-binding receptor  47.42 
 
 
419 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0554  ureA/short-chain amide ABC transporter  50.27 
 
 
402 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.930825  normal  0.0786148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4670  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.58 
 
 
403 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4690  extracellular ligand-binding receptor  47.49 
 
 
397 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5530  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  49.87 
 
 
401 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1336  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
400 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0486  substrate-binding protein  49.73 
 
 
401 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0357  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
408 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000767142 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2475  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  46.65 
 
 
405 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5024  extracellular ligand-binding receptor  48.59 
 
 
400 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.151241  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4400  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  48.94 
 
 
397 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3789  Leu/Ile/Val-binding family protein  47.89 
 
 
409 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.710609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3119  Extracellular ligand-binding receptor  47.13 
 
 
403 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.741733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7539  putative ABC transporter (substrate binding protein)  51.07 
 
 
394 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5957  extracellular ligand-binding receptor  48.53 
 
 
409 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0074  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  47.34 
 
 
399 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0275  putative ureA/short-chain amide ABC transporter  48.98 
 
 
401 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4022  extracellular ligand-binding receptor  46.5 
 
 
404 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339015  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4075  ABC-type transporter, periplasmic component  47.25 
 
 
404 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3342  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  48.74 
 
 
402 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1578  ABC transporter substrate-binding protein  48.35 
 
 
402 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0057  extracellular ligand-binding receptor  46.65 
 
 
405 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5117  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  49.13 
 
 
404 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1437  extracellular ligand-binding receptor  48.38 
 
 
401 aa  368  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1282  extracellular ligand-binding receptor  47.37 
 
 
406 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0780459  normal  0.651455 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0953  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  47.33 
 
 
401 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0894  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.33 
 
 
401 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6729  Extracellular ligand-binding receptor  47.73 
 
 
401 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2466  Extracellular ligand-binding receptor  46.78 
 
 
400 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469696  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0008  Extracellular ligand-binding receptor  48.13 
 
 
408 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0278078 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5823  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  47.69 
 
 
401 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281514  normal  0.102648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3229  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  49.5 
 
 
412 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  45.82 
 
 
411 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481667  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3120  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  46.53 
 
 
400 aa  365  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347887  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1402  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid- binding protein  47.06 
 
 
401 aa  364  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3211  Extracellular ligand-binding receptor  46.65 
 
 
402 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3369  extracellular ligand-binding receptor  47.78 
 
 
402 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3348  extracellular ligand-binding receptor  46.15 
 
 
403 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.164921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3023  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  52.14 
 
 
406 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3537  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  46.65 
 
 
402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277166  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3297  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  47.85 
 
 
400 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300791  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1283  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  48.26 
 
 
401 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154147  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3518  extracellular ligand-binding receptor  46.13 
 
 
402 aa  359  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.36456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1677  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  47.73 
 
 
404 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2465  Extracellular ligand-binding receptor  46.38 
 
 
398 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3520  extracellular ligand-binding receptor  47.04 
 
 
407 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363976  normal  0.545433 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4029  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  47.31 
 
 
400 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6461  Extracellular ligand-binding receptor  44.33 
 
 
402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4450  Extracellular ligand-binding receptor  49.47 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3292  hypothetical protein  46.77 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.406168  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3119  extracellular ligand-binding receptor  46.13 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125075  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3244  extracellular ligand-binding receptor  49.73 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114685  normal  0.545433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0807  extracellular ligand-binding receptor  44.47 
 
 
402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3593  putative ABC transporter substrate binding protein  46.7 
 
 
403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.636574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1339  ABC transporter substrate binding protein  48.4 
 
 
412 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358784  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4449  Extracellular ligand-binding receptor  46.52 
 
 
416 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29774  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1850  putative ABC transporter, substrate binding protein  46.52 
 
 
402 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3267  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.18 
 
 
399 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2137  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  46.67 
 
 
404 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0019  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.47 
 
 
404 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1936  extracellular ligand-binding receptor  48.4 
 
 
409 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0141282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6351  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  47.07 
 
 
403 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3282  Extracellular ligand-binding receptor  46.98 
 
 
408 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0100489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0087  extracellular ligand-binding receptor  46.92 
 
 
399 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356646  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2970  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.92 
 
 
399 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0085  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.92 
 
 
399 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782241  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3913  Extracellular ligand-binding receptor  46.67 
 
 
404 aa  349  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0085  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.65 
 
 
399 aa  349  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56224  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0103  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.65 
 
 
399 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.32797  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3991  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.48 
 
 
398 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1820  Extracellular ligand-binding receptor  45.87 
 
 
404 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4065  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.48 
 
 
398 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>