219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28574 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28574  ELongator Protein 2 90kD subunit has WD40 repeats  100 
 
 		 812 aa  1679    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.33691  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10832  RNA polymerase II Elongator subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05090)  36.96 
 
 		 889 aa  514  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04270  conserved hypothetical protein  31.95 
 
 		 820 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.302416  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46295  predicted protein  32.38 
 
 		 670 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.723496  normal  0.226061 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  21.02 
 
 		 1247 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  21.86 
 
 		 1236 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  21.48 
 
 		 1190 aa  75.5  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  29.1 
 
 		 742 aa  73.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.71 
 
 		 1004 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 1221 aa  71.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.93 
 
 		 1711 aa  70.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  33.57 
 
 		 1363 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  21.14 
 
 		 1831 aa  69.3  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.28 
 
 		 737 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.27 
 
 		 1213 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.58 
 
 		 1652 aa  68.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.68 
 
 		 930 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  24.49 
 
 		 1344 aa  67.8  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.58 
 
 		 1684 aa  67.8  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3199  WD-40 repeat protein  35 
 
 		 299 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304748  normal  0.316415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1661 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  23.2 
 
 		 1242 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 		 1686 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  35.04 
 
 		 1161 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  35.04 
 
 		 1161 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.24 
 
 		 1552 aa  65.1  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  31.43 
 
 		 1357 aa  65.1  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.06 
 
 		 1267 aa  64.7  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.81 
 
 		 1547 aa  64.3  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  28.83 
 
 		 1188 aa  64.3  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.38 
 
 		 696 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.83 
 
 		 676 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  26.55 
 
 		 1164 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.49 
 
 		 1617 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  20.63 
 
 		 1454 aa  63.9  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  29.17 
 
 		 565 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.66 
 
 		 677 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  29.9 
 
 		 1188 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  21.36 
 
 		 1348 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  19.32 
 
 		 1367 aa  62.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 1760 aa  62.4  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  29.5 
 
 		 1789 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.16 
 
 		 947 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.23 
 
 		 1163 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  31.61 
 
 		 1177 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2891  WD-40 repeat protein  29.41 
 
 		 299 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.25 
 
 		 1607 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 716 aa  62  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  31.88 
 
 		 1196 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.98 
 
 		 919 aa  61.6  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  27.04 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.82 
 
 		 1398 aa  61.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  20.41 
 
 		 1399 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.83 
 
 		 757 aa  61.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.56 
 
 		 576 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.88 
 
 		 1609 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  20.54 
 
 		 1217 aa  60.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.79 
 
 		 608 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1858 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  29.29 
 
 		 402 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.05 
 
 		 1364 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  26.95 
 
 		 316 aa  60.1  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1176 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.34 
 
 		 1626 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  22.47 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  19.54 
 
 		 1016 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 1240 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  29.05 
 
 		 1416 aa  58.9  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.99 
 
 		 828 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  19.39 
 
 		 1193 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.88 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.62 
 
 		 1598 aa  58.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.24 
 
 		 1411 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  27.54 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1474 aa  57.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  25.47 
 
 		 418 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  25.1 
 
 		 1334 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1211 aa  57  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  31.62 
 
 		 1714 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.95 
 
 		 833 aa  57  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  27.14 
 
 		 464 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  28.99 
 
 		 1443 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  20.47 
 
 		 439 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  27.74 
 
 		 1330 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  22.7 
 
 		 1208 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  25.51 
 
 		 1766 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  28.17 
 
 		 335 aa  56.6  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.48 
 
 		 692 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1470  WD40 repeat, subgroup  31.91 
 
 		 181 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_311  predicted protein  27.08 
 
 		 833 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.122564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  19.19 
 
 		 1523 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1553 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  28.03 
 
 		 782 aa  55.8  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.85 
 
 		 682 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25 
 
 		 505 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.35 
 
 		 1557 aa  55.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 		 687 aa  55.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  19.4 
 
 		 1016 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.05 
 
 		 664 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  19.97 
 
 		 1209 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>