More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2891 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2891  WD-40 repeat protein  100 
 
 
299 aa  614  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5836  WD40 repeat, subgroup  54.36 
 
 
304 aa  337  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829191  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0759  WD-40 repeat-containing protein  47.32 
 
 
307 aa  293  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3199  WD-40 repeat protein  37.87 
 
 
299 aa  191  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304748  normal  0.316415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.48 
 
 
1652 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.41 
 
 
696 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.6 
 
 
1686 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  23.24 
 
 
565 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.28 
 
 
1789 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  26.01 
 
 
1878 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.75 
 
 
1364 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.84 
 
 
1188 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  29.93 
 
 
657 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.41 
 
 
1196 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  33.97 
 
 
1311 aa  92  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  29.25 
 
 
1348 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.23 
 
 
1363 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  23.57 
 
 
344 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.42 
 
 
947 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.04 
 
 
1557 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.92 
 
 
1221 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  24.75 
 
 
434 aa  89.7  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.39 
 
 
1474 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.43 
 
 
1163 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  30.19 
 
 
1236 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.87 
 
 
1213 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  21.28 
 
 
1523 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.66 
 
 
464 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.99 
 
 
1209 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  25.11 
 
 
335 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.87 
 
 
677 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.78 
 
 
1161 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.37 
 
 
698 aa  86.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.81 
 
 
1193 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  22.95 
 
 
589 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.93 
 
 
1411 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  22.07 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  31.22 
 
 
1661 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.68 
 
 
1711 aa  85.5  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.49 
 
 
1161 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.67 
 
 
664 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  25.42 
 
 
1599 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  21.93 
 
 
1552 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.13 
 
 
576 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  24.92 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.74 
 
 
505 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.21 
 
 
1399 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.74 
 
 
1188 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  23.89 
 
 
1443 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  22.9 
 
 
540 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.87 
 
 
742 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.91 
 
 
1760 aa  82.4  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.67 
 
 
596 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  22.82 
 
 
1177 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.72 
 
 
1262 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.11 
 
 
842 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  21.74 
 
 
919 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  23.61 
 
 
1367 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  32.47 
 
 
954 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.53 
 
 
1454 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  32.19 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.92 
 
 
1217 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.28 
 
 
1357 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.47 
 
 
930 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.83 
 
 
1684 aa  79  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.15 
 
 
740 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.2 
 
 
792 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  31.21 
 
 
1714 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.73 
 
 
676 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.5 
 
 
943 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174955 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 
577 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  21.78 
 
 
1211 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  25 
 
 
1416 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  22.5 
 
 
1807 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.75 
 
 
1609 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.87 
 
 
1901 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  24.8 
 
 
1190 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  24.29 
 
 
1280 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.67 
 
 
1267 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 
1240 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  24.31 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.29 
 
 
1858 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.52 
 
 
1510 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.57 
 
 
675 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.86 
 
 
682 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  24.7 
 
 
840 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.27 
 
 
833 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.08 
 
 
636 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 
578 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.85 
 
 
1599 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.17 
 
 
1164 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  20.76 
 
 
608 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  28.48 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.83 
 
 
630 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.23 
 
 
1481 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  31.01 
 
 
1304 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  30.26 
 
 
1553 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  21.92 
 
 
1831 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  25.18 
 
 
1477 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  28.99 
 
 
782 aa  73.6  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>