More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5836 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5836  WD40 repeat, subgroup  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2891  WD-40 repeat protein  54.36 
 
 		 299 aa  322  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0759  WD-40 repeat-containing protein  47.97 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3199  WD-40 repeat protein  34 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304748  normal  0.316415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.9 
 
 		 1652 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28 
 
 		 1364 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  28.77 
 
 		 696 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.97 
 
 		 1188 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.62 
 
 		 1213 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  29.02 
 
 		 608 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.58 
 
 		 1523 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  30.11 
 
 		 565 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  26.91 
 
 		 1454 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.73 
 
 		 1831 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  30.86 
 
 		 1236 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.85 
 
 		 677 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1474 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.02 
 
 		 1193 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.08 
 
 		 1789 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25 
 
 		 1221 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1190 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.46 
 
 		 596 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.67 
 
 		 1163 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.74 
 
 		 1481 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.32 
 
 		 1363 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.91 
 
 		 464 aa  99.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.93 
 
 		 344 aa  99  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.62 
 
 		 947 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.74 
 
 		 1510 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  25.59 
 
 		 434 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  33.33 
 
 		 657 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.75 
 
 		 1557 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  27.34 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.36 
 
 		 630 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.17 
 
 		 919 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.35 
 
 		 1686 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.53 
 
 		 930 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  27.12 
 
 		 1878 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  35.76 
 
 		 954 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.51 
 
 		 344 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.15 
 
 		 1240 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1196 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.7 
 
 		 676 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  30.65 
 
 		 1443 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.7 
 
 		 1161 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  28.36 
 
 		 578 aa  93.2  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.7 
 
 		 1161 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.57 
 
 		 742 aa  93.2  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  26.91 
 
 		 778 aa  92.8  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1807 aa  92.4  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  26.82 
 
 		 443 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  31.07 
 
 		 577 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.56 
 
 		 1217 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.69 
 
 		 576 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.07 
 
 		 1901 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.44 
 
 		 1760 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.37 
 
 		 1247 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.82 
 
 		 698 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.19 
 
 		 1357 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  26.97 
 
 		 1164 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 		 1311 aa  90.1  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  24.75 
 
 		 505 aa  89.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.68 
 
 		 1599 aa  89.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  26.42 
 
 		 1188 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28 
 
 		 1553 aa  89  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1211 aa  89  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.74 
 
 		 682 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  26.52 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  30.46 
 
 		 1416 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.26 
 
 		 1262 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.05 
 
 		 1267 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  25.53 
 
 		 728 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.68 
 
 		 664 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1552 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.74 
 
 		 842 aa  86.7  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.33 
 
 		 1711 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  23.99 
 
 		 1280 aa  85.9  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  25.85 
 
 		 540 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  25.57 
 
 		 790 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.61 
 
 		 675 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  25.09 
 
 		 589 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.75 
 
 		 1209 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_006686  CND05450  conserved hypothetical protein  29.76 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723357  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  23.19 
 
 		 1399 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  28.93 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  35.67 
 
 		 1766 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  27.67 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  25.84 
 
 		 1334 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.75 
 
 		 692 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.83 
 
 		 574 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.92 
 
 		 943 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.72 
 
 		 737 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1661 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.02 
 
 		 642 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.65 
 
 		 740 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.39 
 
 		 1190 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.29 
 
 		 924 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  31.33 
 
 		 1242 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  25.63 
 
 		 1858 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>