237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47119 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47119  nucleotide-binding protein  100 
 
 		 459 aa  942    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31740  predicted protein  30.25 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_3307  predicted protein  27.12 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.272794  normal  0.166953 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05235  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09620)  26.42 
 
 		 469 aa  90.1  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.783705  normal  0.0488929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.86 
 
 		 1557 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.05 
 
 		 1357 aa  73.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  25.93 
 
 		 565 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.79 
 
 		 1652 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1789 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.45 
 
 		 1626 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.83 
 
 		 947 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.48 
 
 		 1262 aa  67  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  29.18 
 
 		 1901 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1211 aa  66.6  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1196 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.58 
 
 		 1623 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.28 
 
 		 1609 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.95 
 
 		 1188 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.71 
 
 		 1163 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  24.33 
 
 		 1399 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  25.36 
 
 		 1344 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.47 
 
 		 664 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 1221 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  29.61 
 
 		 1443 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.36 
 
 		 1831 aa  63.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  21.97 
 
 		 505 aa  63.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.59 
 
 		 1267 aa  63.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  21.29 
 
 		 1236 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  29.29 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  23.58 
 
 		 1217 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.37 
 
 		 1161 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.84 
 
 		 642 aa  60.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.37 
 
 		 1161 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.35 
 
 		 677 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  22.2 
 
 		 1100 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.82 
 
 		 675 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  23.28 
 
 		 574 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.33 
 
 		 696 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  27.08 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.7 
 
 		 1598 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  24.4 
 
 		 790 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.86 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.62 
 
 		 1686 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.19 
 
 		 1240 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1214 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  24.58 
 
 		 1279 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  24.58 
 
 		 1279 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.39 
 
 		 1807 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  28.33 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.75 
 
 		 1607 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61538  histone acetyltransferase subunit  27.46 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.204154 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.71 
 
 		 1364 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22 
 
 		 1617 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  21.25 
 
 		 1330 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.1 
 
 		 1363 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.08 
 
 		 1684 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  28.26 
 
 		 1355 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  25.44 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  29.32 
 
 		 1208 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  25 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.07 
 
 		 1599 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  23.6 
 
 		 742 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  28.08 
 
 		 342 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  22.44 
 
 		 1491 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.07 
 
 		 1193 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.66 
 
 		 740 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  24.51 
 
 		 367 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  24.14 
 
 		 1242 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  24.1 
 
 		 1334 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.2 
 
 		 1552 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  22.56 
 
 		 335 aa  55.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1858 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.1 
 
 		 1523 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42874  predicted protein  24.56 
 
 		 572 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0187431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  27.11 
 
 		 872 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.34 
 
 		 1474 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  23.89 
 
 		 1209 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  22.42 
 
 		 316 aa  54.3  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.28 
 
 		 1766 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37533  predicted protein  25.78 
 
 		 485 aa  54.3  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05200  WD-repeat protein, putative  26.03 
 
 		 988 aa  53.9  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.67 
 
 		 622 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.24 
 
 		 1039 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  21.33 
 
 		 520 aa  53.5  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  21.29 
 
 		 317 aa  53.5  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  22.22 
 
 		 1484 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  25.32 
 
 		 335 aa  53.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.69 
 
 		 1454 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  25.42 
 
 		 840 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.37 
 
 		 919 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  29.94 
 
 		 657 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.08 
 
 		 1481 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2529  WD-40 repeat protein  32.39 
 
 		 248 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00110539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  21.64 
 
 		 1348 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.42 
 
 		 1213 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  23.53 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  24.1 
 
 		 1714 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  24.21 
 
 		 1416 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  22.8 
 
 		 1510 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  25.99 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>