More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_49918 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  100 
 
 		 520 aa  1070    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  55.34 
 
 		 518 aa  580  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_006686  CND05450  conserved hypothetical protein  44.47 
 
 		 523 aa  474  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723357  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  47.64 
 
 		 495 aa  465  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  42.55 
 
 		 551 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  34.89 
 
 		 696 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.68 
 
 		 1652 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  36.2 
 
 		 1363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.06 
 
 		 1557 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  32.97 
 
 		 1163 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  37.7 
 
 		 1443 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  34.55 
 
 		 1364 aa  197  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  32.23 
 
 		 1523 aa  197  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  32.79 
 
 		 1831 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  32.51 
 
 		 1193 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.14 
 
 		 1868 aa  195  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  33.42 
 
 		 1474 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  34.46 
 
 		 1789 aa  193  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  33.76 
 
 		 1454 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.81 
 
 		 1357 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  33.5 
 
 		 1188 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  33.07 
 
 		 947 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.19 
 
 		 1240 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.73 
 
 		 919 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  32.12 
 
 		 1196 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  32.95 
 
 		 1211 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  32.23 
 
 		 1236 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  30.87 
 
 		 1367 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 1221 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.77 
 
 		 1609 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  32.9 
 
 		 1510 aa  174  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.59 
 
 		 1247 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.57 
 
 		 1686 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  33.25 
 
 		 1661 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  33.07 
 
 		 1553 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.82 
 
 		 1262 aa  170  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.31 
 
 		 930 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.77 
 
 		 1217 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.83 
 
 		 924 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.35 
 
 		 1583 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.87 
 
 		 1711 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.86 
 
 		 1481 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  31.25 
 
 		 1416 aa  167  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.8 
 
 		 1598 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.33 
 
 		 1267 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1190 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.05 
 
 		 1684 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.27 
 
 		 1547 aa  163  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  29.79 
 
 		 728 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  30.29 
 
 		 1552 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.61 
 
 		 1599 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.72 
 
 		 1760 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.71 
 
 		 1607 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  28.41 
 
 		 657 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1714 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  30.66 
 
 		 1599 aa  157  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  30.2 
 
 		 1878 aa  156  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.98 
 
 		 1344 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.42 
 
 		 740 aa  156  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.75 
 
 		 1398 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  32.66 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  31.54 
 
 		 505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  31.11 
 
 		 1229 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.4 
 
 		 1626 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.03 
 
 		 716 aa  154  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  33.73 
 
 		 1656 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.7 
 
 		 1623 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  29.2 
 
 		 344 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  29.74 
 
 		 316 aa  151  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  28.38 
 
 		 1016 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  30.1 
 
 		 1161 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.82 
 
 		 1901 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  30.67 
 
 		 1858 aa  147  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.49 
 
 		 576 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 1348 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  27.42 
 
 		 1016 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.84 
 
 		 1161 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.71 
 
 		 1188 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.01 
 
 		 1213 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30 
 
 		 1617 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 664 aa  144  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.67 
 
 		 675 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.91 
 
 		 676 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.21 
 
 		 682 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  30.14 
 
 		 1280 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.11 
 
 		 677 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.31 
 
 		 630 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1399 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  27.94 
 
 		 316 aa  137  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  31.76 
 
 		 577 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  29.97 
 
 		 742 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.7 
 
 		 1242 aa  137  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  28.74 
 
 		 335 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.78 
 
 		 737 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  26.93 
 
 		 1164 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  31.7 
 
 		 317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  30.37 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  28.49 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.98 
 
 		 1807 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  27.86 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>