167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61538 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_61538  histone acetyltransferase subunit  100 
 
 
397 aa  823    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  36.16 
 
 
466 aa  276  4e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  36.54 
 
 
432 aa  272  9e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  35.14 
 
 
435 aa  260  3e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08187  kinetochore protein (Eurofung)  34.47 
 
 
411 aa  236  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7955  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47485  chromatin assembly complex, subunit 3  24.76 
 
 
429 aa  161  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.884795  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40760  subunit of histone acetyltransferase  27.65 
 
 
402 aa  142  9e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500001  normal  0.43958 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35336  predicted protein  24.94 
 
 
486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292419  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  25.68 
 
 
489 aa  87  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  28.31 
 
 
492 aa  87  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  23.33 
 
 
441 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86817  Ribosome assembly protein  24.31 
 
 
506 aa  76.6  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.189505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.13 
 
 
664 aa  73.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05235  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09620)  24.6 
 
 
469 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.783705  normal  0.0488929 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47947  g-protein beta-subunit  25 
 
 
501 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000283935  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  25.17 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.64 
 
 
1163 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31512  predicted protein  23.28 
 
 
538 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268234  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  28.46 
 
 
813 aa  66.2  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.15 
 
 
1652 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8842  predicted protein  22.64 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09085  U5 snRNP complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02280)  25.08 
 
 
359 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320529  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.2 
 
 
596 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  22.82 
 
 
344 aa  63.2  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  22.69 
 
 
1411 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.55 
 
 
757 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01695  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G08530)  28.42 
 
 
609 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.416154  normal  0.0260007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.62 
 
 
792 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3024  predicted protein  25 
 
 
308 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.575089  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.86 
 
 
1557 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  25.34 
 
 
687 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.91 
 
 
1221 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2891  WD-40 repeat protein  27.59 
 
 
299 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.7 
 
 
930 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  29.11 
 
 
756 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
1711 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 
676 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04518  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03080)  27.39 
 
 
1289 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  26.12 
 
 
1443 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.24 
 
 
947 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  26.88 
 
 
618 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  30.59 
 
 
696 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21897  G protein beta subunit  29.57 
 
 
351 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  23.19 
 
 
540 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  27.44 
 
 
657 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47119  nucleotide-binding protein  27.46 
 
 
459 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.81 
 
 
828 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.37 
 
 
1236 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  26.25 
 
 
1209 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.91 
 
 
576 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.74 
 
 
919 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76043  predicted protein  23.48 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.334358  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  24.28 
 
 
1208 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04226  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (SOF1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06290)  22.81 
 
 
447 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.98 
 
 
742 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30.08 
 
 
1196 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.97 
 
 
1363 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  22.83 
 
 
1789 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.19 
 
 
1193 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49403  predicted protein  22.44 
 
 
332 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.220793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.27 
 
 
630 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.81 
 
 
943 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  22.88 
 
 
1209 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.86 
 
 
1213 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31740  predicted protein  23.51 
 
 
458 aa  53.1  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.87 
 
 
1188 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.51 
 
 
1686 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.89 
 
 
1552 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.03 
 
 
1217 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  28.11 
 
 
564 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_2648  predicted protein  25.12 
 
 
326 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  29.48 
 
 
1357 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27518  predicted protein  28.93 
 
 
962 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 
577 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.85 
 
 
716 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  25.74 
 
 
1190 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.91 
 
 
675 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9860  predicted protein  27.21 
 
 
318 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  28.49 
 
 
516 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  31.87 
 
 
954 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.64 
 
 
677 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.07 
 
 
1474 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42488  predicted protein  31.87 
 
 
467 aa  50.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.206932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.69 
 
 
1760 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.57 
 
 
1364 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01560  transparent testa glabra 1 protein (ttg1 protein), putative  25.28 
 
 
418 aa  50.1  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.68 
 
 
1901 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  22.42 
 
 
333 aa  49.7  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  24.62 
 
 
518 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.19 
 
 
682 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  26.26 
 
 
1177 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  35.78 
 
 
1657 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  37.08 
 
 
1858 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  24.23 
 
 
1344 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05930  snoRNA binding protein, putative  24.12 
 
 
1382 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192675  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.79 
 
 
1229 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  22.64 
 
 
1831 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  30.99 
 
 
578 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  24.43 
 
 
316 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28574  ELongator Protein 2 90kD subunit has WD40 repeats  24.86 
 
 
812 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.33691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>