132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86817 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_86817  Ribosome assembly protein  100 
 
 		 506 aa  1033    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.189505 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  46.71 
 
 		 492 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  38.49 
 
 		 489 aa  303  5.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  37.5 
 
 		 441 aa  269  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47947  g-protein beta-subunit  37.33 
 
 		 501 aa  245  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000283935  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  26.68 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  27.27 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  26.71 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08187  kinetochore protein (Eurofung)  25.37 
 
 		 411 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61538  histone acetyltransferase subunit  24.33 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47485  chromatin assembly complex, subunit 3  22.07 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.884795  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.91 
 
 		 828 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47010  predicted protein  25.73 
 
 		 1133 aa  62.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.671968  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  33.62 
 
 		 1217 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80311  component of the COPII coat of ER-Golgi vesicles  28.57 
 
 		 1244 aa  62.4  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.812288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.14 
 
 		 943 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  31.82 
 
 		 1117 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35336  predicted protein  21.65 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  32.28 
 
 		 540 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05930  snoRNA binding protein, putative  25.5 
 
 		 1382 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  31.62 
 
 		 1344 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  28.7 
 
 		 1411 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.72 
 
 		 1481 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08701  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02410)  26.28 
 
 		 1462 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01430  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 		 712 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00570  transcription factor, putative  23.28 
 
 		 550 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414146  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1196 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.5 
 
 		 642 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39452  predicted protein  23.56 
 
 		 1077 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06160  Polyadenylation factor subunit 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZX0]  27.4 
 
 		 567 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.22 
 
 		 924 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.51 
 
 		 1510 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.1 
 
 		 919 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  28.88 
 
 		 511 aa  50.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.58 
 
 		 675 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1401 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.66 
 
 		 740 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 1221 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  25.68 
 
 		 617 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27655  predicted protein  26.47 
 
 		 843 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01335  protein transport protein (LST8), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09560)  29.06 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.809459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  27.88 
 
 		 840 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  24.87 
 
 		 813 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  30.97 
 
 		 742 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.51 
 
 		 1760 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82025  predicted protein  25.55 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.830676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.83 
 
 		 806 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.79 
 
 		 1163 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.21 
 
 		 733 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1858 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32128  predicted protein  33.33 
 
 		 319 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1041 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.17 
 
 		 1357 aa  48.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.31 
 
 		 576 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.99 
 
 		 1039 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.18 
 
 		 833 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  29.13 
 
 		 1164 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30256  beta transducin  32.98 
 
 		 977 aa  47.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11703  predicted protein  31.75 
 
 		 820 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00630  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  24.11 
 
 		 870 aa  47.4  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.08 
 
 		 737 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  28.21 
 
 		 618 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1211 aa  47.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49403  predicted protein  26.87 
 
 		 332 aa  47  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.220793  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  28.45 
 
 		 1193 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.25 
 
 		 865 aa  47  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03737  WD repeat-containing protein AN3737 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6U3]  29.2 
 
 		 525 aa  47  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  26.98 
 
 		 363 aa  47  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06257  Protein transport protein sec31 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZM3]  25 
 
 		 1282 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0130265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07530  57.7 kda trp-asp repeats containing protein, putative  25.58 
 
 		 523 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.94 
 
 		 947 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  28.17 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  30.65 
 
 		 1304 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65933  predicted protein  28.46 
 
 		 1468 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.70896  normal  0.0114479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  31.2 
 
 		 1334 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.31 
 
 		 1161 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  27.74 
 
 		 405 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  26.72 
 
 		 1016 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.85 
 
 		 1188 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47119  nucleotide-binding protein  25.58 
 
 		 459 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  26.72 
 
 		 1016 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  29.31 
 
 		 1161 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.49 
 
 		 630 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56141  protein involved in cell-cycle regulation of histone transcription  26.96 
 
 		 959 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0125544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3024  predicted protein  24.66 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.575089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  27.34 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  27.43 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00806  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_1G14650)  26.36 
 
 		 360 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.13344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1474 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1477 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28.69 
 
 		 1831 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  30.06 
 
 		 1209 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45416  predicted protein  27.94 
 
 		 632 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.1 
 
 		 1348 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  24.1 
 
 		 333 aa  44.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.22 
 
 		 1901 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.53 
 
 		 898 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  28.07 
 
 		 891 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8842  predicted protein  26.36 
 
 		 379 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  26.61 
 
 		 1443 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>