More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30256 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00305  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit Dip2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02680)  42.75 
 
 		 963 aa  750    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140894  normal  0.864535 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30256  beta transducin  100 
 
 		 977 aa  2003    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05200  WD-repeat protein, putative  36.92 
 
 		 988 aa  598  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_311  predicted protein  32.54 
 
 		 833 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.122564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18258  predicted protein  31.61 
 
 		 743 aa  318  4e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.175044  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.22 
 
 		 1236 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  23.22 
 
 		 1523 aa  180  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.47 
 
 		 1163 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1196 aa  172  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.63 
 
 		 1454 aa  164  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.96 
 
 		 1363 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.23 
 
 		 696 aa  161  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.5 
 
 		 1652 aa  160  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 947 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.43 
 
 		 1193 aa  151  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 1221 aa  149  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.66 
 
 		 1474 aa  147  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.47 
 
 		 1868 aa  146  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  20.11 
 
 		 1831 aa  145  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  21.78 
 
 		 1188 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.17 
 
 		 1711 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  20.96 
 
 		 1901 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05910  hypothetical protein  23.14 
 
 		 949 aa  134  9e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.88 
 
 		 1213 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  21.16 
 
 		 1217 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  23.47 
 
 		 1443 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  23.2 
 
 		 1176 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1552 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  22.41 
 
 		 1789 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  22.24 
 
 		 1177 aa  129  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  21.91 
 
 		 1208 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.78 
 
 		 1609 aa  125  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.29 
 
 		 1607 aa  125  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  23.18 
 
 		 728 aa  124  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.23 
 
 		 1598 aa  124  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.08 
 
 		 1364 aa  123  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  21.19 
 
 		 1357 aa  122  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.89 
 
 		 1686 aa  122  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  22.19 
 
 		 1510 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  19.75 
 
 		 1557 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.32 
 
 		 1348 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  21.39 
 
 		 1188 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  20.06 
 
 		 919 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.78 
 
 		 740 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.77 
 
 		 1583 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  21.87 
 
 		 1344 aa  117  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.01 
 
 		 1547 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.34 
 
 		 1684 aa  115  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  22.44 
 
 		 464 aa  115  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  22.43 
 
 		 1553 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.47 
 
 		 1617 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  21.71 
 
 		 1367 aa  114  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.76 
 
 		 1247 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  22.38 
 
 		 1330 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.61 
 
 		 630 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  25.45 
 
 		 574 aa  112  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.63 
 
 		 1760 aa  112  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.62 
 
 		 1626 aa  111  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  20.9 
 
 		 1262 aa  111  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  24.42 
 
 		 564 aa  111  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.04 
 
 		 1481 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.41 
 
 		 677 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.14 
 
 		 642 aa  110  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83827  predicted protein  21.05 
 
 		 789 aa  110  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0497188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  21.43 
 
 		 1211 aa  109  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.55 
 
 		 792 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1858 aa  109  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  19.28 
 
 		 1242 aa  108  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.37 
 
 		 1623 aa  108  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  22.95 
 
 		 1190 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.39 
 
 		 344 aa  107  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.39 
 
 		 1599 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  22.49 
 
 		 1373 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  22.43 
 
 		 1661 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.94 
 
 		 676 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  20.35 
 
 		 1214 aa  105  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  21.48 
 
 		 1411 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11703  predicted protein  28.86 
 
 		 820 aa  105  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.66 
 
 		 1240 aa  104  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  20.4 
 
 		 1807 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  25.4 
 
 		 1878 aa  103  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  29.11 
 
 		 589 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.94 
 
 		 1823 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.16 
 
 		 344 aa  102  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  22.07 
 
 		 1229 aa  102  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  24.45 
 
 		 778 aa  102  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  19.75 
 
 		 1484 aa  101  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  26.45 
 
 		 505 aa  101  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  28.74 
 
 		 578 aa  101  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.85 
 
 		 636 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  23.15 
 
 		 522 aa  100  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  20.18 
 
 		 1190 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  24.45 
 
 		 774 aa  100  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  22.43 
 
 		 924 aa  100  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1041 aa  98.6  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.95 
 
 		 930 aa  97.8  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.89 
 
 		 596 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  22.63 
 
 		 1477 aa  97.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  22.65 
 
 		 1656 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  19.87 
 
 		 1416 aa  96.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>