37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47485 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_47485  chromatin assembly complex, subunit 3  100 
 
 		 429 aa  882    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.884795  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  32.33 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  29.79 
 
 		 432 aa  199  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  28.37 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61538  histone acetyltransferase subunit  24.76 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.204154 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08187  kinetochore protein (Eurofung)  27.94 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47947  g-protein beta-subunit  27.47 
 
 		 501 aa  104  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000283935  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  23.94 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40760  subunit of histone acetyltransferase  25.41 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500001  normal  0.43958 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  23.23 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35336  predicted protein  19.87 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86817  Ribosome assembly protein  26.78 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.189505 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  23.89 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80311  component of the COPII coat of ER-Golgi vesicles  22.77 
 
 		 1244 aa  57.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.812288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3024  predicted protein  24.77 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.575089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1424 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06257  Protein transport protein sec31 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZM3]  23.39 
 
 		 1282 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0130265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  22.09 
 
 		 344 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.79 
 
 		 1831 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04518  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03080)  22.88 
 
 		 1289 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  27.08 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47010  predicted protein  24.03 
 
 		 1133 aa  50.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.671968  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36759  protein required for amino acid permease transport from the Golgi to the cell surface  25.58 
 
 		 318 aa  49.7  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  23.64 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31512  predicted protein  20.09 
 
 		 538 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02300  structural molecule, putative  19.33 
 
 		 1433 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.781693  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8842  predicted protein  21.64 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49403  predicted protein  21.31 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.220793  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31975  predicted protein  24.49 
 
 		 397 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.84 
 
 		 1711 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2891  WD-40 repeat protein  27.05 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0981468 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06341  putative coronin homolog (Eurofung)  22.6 
 
 		 611 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.592518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  24.52 
 
 		 1443 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01695  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G08530)  23.64 
 
 		 609 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.416154  normal  0.0260007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.24 
 
 		 1686 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  24.08 
 
 		 402 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.43 
 
 		 596 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>