155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40760 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_40760  subunit of histone acetyltransferase  100 
 
 
402 aa  819    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500001  normal  0.43958 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  31.36 
 
 
432 aa  194  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08187  kinetochore protein (Eurofung)  31.43 
 
 
411 aa  189  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7955  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  28.61 
 
 
435 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  27.23 
 
 
466 aa  150  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61538  histone acetyltransferase subunit  27.65 
 
 
397 aa  142  9e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47485  chromatin assembly complex, subunit 3  25.41 
 
 
429 aa  82.4  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.884795  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  25 
 
 
489 aa  80.1  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  26.15 
 
 
492 aa  73.2  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  26.3 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.39 
 
 
1236 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  25.9 
 
 
728 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.67 
 
 
698 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.83 
 
 
676 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  27.98 
 
 
405 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47947  g-protein beta-subunit  21.28 
 
 
501 aa  65.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000283935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.42 
 
 
919 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  22.16 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.83 
 
 
947 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.35 
 
 
1357 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.96 
 
 
1363 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01468  pre-mRNA splicing factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04590)  24.17 
 
 
521 aa  63.5  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559626  hitchhiker  0.00529797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.48 
 
 
1163 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56432  predicted protein  29.03 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491701  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  25 
 
 
1416 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  24.77 
 
 
441 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.51 
 
 
1557 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39452  predicted protein  26.44 
 
 
1077 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.18 
 
 
1652 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  28.29 
 
 
452 aa  60.1  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.33 
 
 
682 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  23.46 
 
 
1523 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  22.13 
 
 
1211 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.17 
 
 
1481 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.17 
 
 
1510 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.71 
 
 
1711 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  24.17 
 
 
1367 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.27 
 
 
1221 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  22.88 
 
 
1176 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.1 
 
 
1474 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.5 
 
 
1686 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.45 
 
 
1193 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50173  predicted protein  30.07 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828985  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  24.14 
 
 
652 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  25.57 
 
 
473 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35336  predicted protein  21.22 
 
 
486 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292419  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00880  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 7 (Eurofung)  24.39 
 
 
355 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07530  57.7 kda trp-asp repeats containing protein, putative  22.22 
 
 
523 aa  53.9  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.08 
 
 
1196 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  26.51 
 
 
1177 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  24.53 
 
 
1242 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.7 
 
 
576 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3024  predicted protein  20.73 
 
 
308 aa  53.5  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.575089  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.31 
 
 
1760 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03026  Coatomer alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59946]  25.57 
 
 
1205 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  23.62 
 
 
1491 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  24.06 
 
 
516 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.41 
 
 
696 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  21.95 
 
 
565 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  19.21 
 
 
943 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  24.64 
 
 
928 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  27.78 
 
 
504 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  23.38 
 
 
1190 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.38 
 
 
1609 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.43 
 
 
1583 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30495  predicted protein  28.1 
 
 
478 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.58 
 
 
622 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.46 
 
 
930 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  22.58 
 
 
1553 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  22.68 
 
 
1789 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01430  conserved hypothetical protein  24.72 
 
 
712 aa  50.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  24.1 
 
 
1443 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  27.42 
 
 
346 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.32 
 
 
1247 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31512  predicted protein  22.51 
 
 
538 aa  50.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268234  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.75 
 
 
1411 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  23.51 
 
 
1399 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  23.11 
 
 
505 aa  49.7  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0759  WD-40 repeat-containing protein  27.47 
 
 
307 aa  50.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05235  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09620)  24.7 
 
 
469 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.783705  normal  0.0488929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.94 
 
 
1477 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  24.28 
 
 
1661 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.31 
 
 
677 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  25.64 
 
 
578 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13526  predicted protein  21.9 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  19.78 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.12 
 
 
1209 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  30.26 
 
 
813 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  21.89 
 
 
742 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.82 
 
 
1161 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  24.4 
 
 
520 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.82 
 
 
1161 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  23.19 
 
 
617 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.39 
 
 
1607 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1164 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  20.81 
 
 
1552 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.7 
 
 
1213 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8225  Serine/threonine protein kinase-like protein  22.11 
 
 
612 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  25.94 
 
 
443 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  21.46 
 
 
1454 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>