60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_39452 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009366  OSTLU_39452  predicted protein  100 
 
 		 1077 aa  2195    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06257  Protein transport protein sec31 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZM3]  30.22 
 
 		 1282 aa  372  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0130265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02300  structural molecule, putative  35.58 
 
 		 1433 aa  310  6.999999999999999e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.781693  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47010  predicted protein  24.89 
 
 		 1133 aa  297  8e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.671968  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80311  component of the COPII coat of ER-Golgi vesicles  26.83 
 
 		 1244 aa  290  7e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.812288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  25.97 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  28.74 
 
 		 466 aa  74.3  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28885  predicted protein  30.83 
 
 		 190 aa  69.7  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  23.96 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08701  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02410)  31.2 
 
 		 1462 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  28.22 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40760  subunit of histone acetyltransferase  26.44 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500001  normal  0.43958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.63 
 
 		 682 aa  59.3  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.49 
 
 		 947 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31512  predicted protein  27.27 
 
 		 538 aa  58.9  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268234  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  21.93 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.22 
 
 		 1868 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.71 
 
 		 943 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  26.14 
 
 		 441 aa  55.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  27.78 
 
 		 333 aa  55.1  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  22.35 
 
 		 618 aa  55.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.83 
 
 		 1831 aa  54.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  23.95 
 
 		 1188 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  28.47 
 
 		 489 aa  54.3  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  25.1 
 
 		 1247 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60422  Anaphase promoting complex, Cdc20, Cdh1, and Ama1 subunits  24.78 
 
 		 606 aa  53.1  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0258517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86817  Ribosome assembly protein  23.56 
 
 		 506 aa  52.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.189505 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8842  predicted protein  24.86 
 
 		 379 aa  52  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02861  F-box and WD40 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11870)  29.27 
 
 		 656 aa  51.6  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.58 
 
 		 833 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.88 
 
 		 1193 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06341  putative coronin homolog (Eurofung)  24.48 
 
 		 611 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.592518  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04518  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03080)  23.35 
 
 		 1289 aa  50.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.24 
 
 		 1205 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25.82 
 
 		 464 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  24.89 
 
 		 1242 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 1221 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19794  Receptor of activated protein kinase C 1A, component of 40S small ribosomal subunit  26.88 
 
 		 321 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48240  Receptor of activated protein kinase C 1B, component of 40S small ribosomal subunit  26.88 
 
 		 321 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.51 
 
 		 1477 aa  49.7  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.12 
 
 		 1652 aa  49.3  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.52 
 
 		 1523 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  24.25 
 
 		 1041 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.36 
 
 		 1163 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.68 
 
 		 1411 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  25.1 
 
 		 495 aa  48.5  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.48 
 
 		 930 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08187  kinetochore protein (Eurofung)  26.17 
 
 		 411 aa  48.5  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2302  WD-40 repeat protein  26.95 
 
 		 1142 aa  47.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.616134 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  25.89 
 
 		 316 aa  47.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  20.95 
 
 		 1474 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  25.49 
 
 		 484 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09085  U5 snRNP complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02280)  20.59 
 
 		 359 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.09 
 
 		 1443 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.56 
 
 		 696 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.26 
 
 		 1190 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  21.96 
 
 		 813 aa  45.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  26.82 
 
 		 1208 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  22.47 
 
 		 443 aa  44.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  26.47 
 
 		 402 aa  44.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>