88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47010 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47010  predicted protein  100 
 
 		 1133 aa  2337    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.671968  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39452  predicted protein  26.92 
 
 		 1077 aa  269  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06257  Protein transport protein sec31 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZM3]  26.51 
 
 		 1282 aa  242  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0130265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02300  structural molecule, putative  25.48 
 
 		 1433 aa  171  5e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.781693  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80311  component of the COPII coat of ER-Golgi vesicles  24.52 
 
 		 1244 aa  169  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.812288  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  29.05 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  27.79 
 
 		 344 aa  67.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  30.34 
 
 		 489 aa  67  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  23.84 
 
 		 432 aa  66.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.27 
 
 		 919 aa  66.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  24.71 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86817  Ribosome assembly protein  24.89 
 
 		 506 aa  64.7  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.189505 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  27.49 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.7 
 
 		 1217 aa  61.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.71 
 
 		 696 aa  61.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03300  microtubule binding protein, putative  29.2 
 
 		 694 aa  59.7  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.89 
 
 		 842 aa  59.7  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.67 
 
 		 1831 aa  59.3  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.56 
 
 		 1652 aa  58.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47947  g-protein beta-subunit  33.59 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000283935  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3024  predicted protein  28.96 
 
 		 308 aa  55.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.575089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  30.97 
 
 		 402 aa  55.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.49 
 
 		 1163 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.03 
 
 		 1411 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  26.34 
 
 		 333 aa  53.5  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.86 
 
 		 1188 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.37 
 
 		 947 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.82 
 
 		 1357 aa  53.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  28.57 
 
 		 1484 aa  53.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  30.46 
 
 		 439 aa  52.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  28.24 
 
 		 363 aa  52.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47485  chromatin assembly complex, subunit 3  24.03 
 
 		 429 aa  52.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.884795  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87280  predicted protein  31.3 
 
 		 1204 aa  52  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0864133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  27.38 
 
 		 618 aa  52  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.57 
 
 		 642 aa  51.6  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  31.71 
 
 		 1443 aa  51.6  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  25.56 
 
 		 435 aa  50.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.51 
 
 		 1161 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  29.51 
 
 		 1161 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.54 
 
 		 1193 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  28.07 
 
 		 511 aa  50.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21794  predicted protein  24.16 
 
 		 346 aa  49.7  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17027  predicted protein  28.15 
 
 		 500 aa  50.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.625475  normal  0.0184587 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25989  predicted protein  33.8 
 
 		 215 aa  49.7  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01335  protein transport protein (LST8), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09560)  27.88 
 
 		 393 aa  49.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.809459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47119  nucleotide-binding protein  26.58 
 
 		 459 aa  49.3  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.43 
 
 		 1344 aa  48.9  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06341  putative coronin homolog (Eurofung)  28.26 
 
 		 611 aa  48.9  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.592518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49065  predicted protein  43.75 
 
 		 2083 aa  48.5  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  34.15 
 
 		 1214 aa  48.5  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10942  conserved hypothetical protein similar to Aip1 (Eurofung)  33.33 
 
 		 607 aa  48.5  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.578742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.85 
 
 		 698 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1367 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.95 
 
 		 676 aa  48.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.32 
 
 		 1039 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04518  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03080)  22.56 
 
 		 1289 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.93 
 
 		 865 aa  47  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 1221 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38586  predicted protein  31.3 
 
 		 191 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.107444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.62 
 
 		 1256 aa  47  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  28.94 
 
 		 1355 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31740  predicted protein  21.59 
 
 		 458 aa  46.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49403  predicted protein  25 
 
 		 332 aa  46.2  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.220793  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04800  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06910)  26.27 
 
 		 660 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.213896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  25.15 
 
 		 443 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  31.58 
 
 		 1275 aa  46.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.18 
 
 		 1363 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  28.03 
 
 		 317 aa  46.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06160  Polyadenylation factor subunit 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZX0]  26.15 
 
 		 567 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.68 
 
 		 792 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  27.91 
 
 		 520 aa  46.2  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61538  histone acetyltransferase subunit  20.6 
 
 		 397 aa  45.8  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.204154 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01387  meiotic recombination protein Ski8/Rec14, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08860)  28.05 
 
 		 306 aa  45.8  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00480  coatomer alpha subunit, putative  23.39 
 
 		 1222 aa  45.8  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.68 
 
 		 576 aa  45.8  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.42 
 
 		 664 aa  45.8  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60422  Anaphase promoting complex, Cdc20, Cdh1, and Ama1 subunits  25.48 
 
 		 606 aa  45.8  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0258517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  29.08 
 
 		 1491 aa  45.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.5 
 
 		 1262 aa  45.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21929  predicted protein  24.44 
 
 		 1270 aa  45.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42874  predicted protein  23.94 
 
 		 572 aa  45.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0187431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.92 
 
 		 675 aa  45.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.91 
 
 		 1789 aa  45.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  31.86 
 
 		 1424 aa  45.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.79 
 
 		 682 aa  45.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1211 aa  44.7  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35336  predicted protein  25.19 
 
 		 486 aa  44.7  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.09 
 
 		 1868 aa  44.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>