15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49065 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_49065  predicted protein  100 
 
 		 2083 aa  4234    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26531  predicted protein  25.24 
 
 		 1174 aa  120  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.297969  normal  0.104037 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06615  COPII coat assembly protein sec16 (Protein transport protein sec16) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AYL5]  23.54 
 
 		 1947 aa  77  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.874293  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68327  hypothetical protein  22.78 
 
 		 2212 aa  71.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01360  conserved hypothetical protein  22.39 
 
 		 1994 aa  62  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.118703  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33395  predicted protein  36.46 
 
 		 287 aa  61.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01339  ubiquitin-protein ligase (Rsp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09500)  26.75 
 
 		 821 aa  58.9  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38671  predicted protein  32.71 
 
 		 306 aa  58.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.292382  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40080  predicted protein  56.41 
 
 		 743 aa  56.6  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00220  ubiquitin-protein ligase, putative  24.22 
 
 		 833 aa  50.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.311807  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00830  hypothetical protein  39.56 
 
 		 835 aa  49.7  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47710  predicted protein  38.27 
 
 		 1041 aa  48.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65602  predicted protein  26.99 
 
 		 776 aa  48.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.62617  normal  0.190036 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47010  predicted protein  43.75 
 
 		 1133 aa  48.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.671968  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48210  predicted protein  40.74 
 
 		 935 aa  45.8  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>