36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65602 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_65602  predicted protein  100 
 
 		 776 aa  1611    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.62617  normal  0.190036 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01339  ubiquitin-protein ligase (Rsp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09500)  66.67 
 
 		 821 aa  1068    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00220  ubiquitin-protein ligase, putative  61.6 
 
 		 833 aa  1045    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.311807  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01966  ubiquitin-protein ligase (Tom1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10780)  47.62 
 
 		 4022 aa  368  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81688  E3 ubiquitin protein ligase TOM1 (Temperature dependent-organization in mitotic nucleus protein 1)  48.32 
 
 		 3268 aa  362  1e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.325065 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12562  predicted protein  44.05 
 
 		 384 aa  336  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637847  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01260  ubiquitin-protein ligase, putative  42.46 
 
 		 3251 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52147  predicted protein  42.21 
 
 		 406 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41898  predicted protein  42.21 
 
 		 406 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14177  predicted protein  40.44 
 
 		 370 aa  268  4e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.324881  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14345  predicted protein  40.18 
 
 		 367 aa  250  7e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01540  hypothetical protein  33.99 
 
 		 1063 aa  204  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66630  predicted protein  33.98 
 
 		 950 aa  193  9e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.214435 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00444  ubiquitin-protein ligase (Hul4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04640)  31.47 
 
 		 1090 aa  185  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358914  normal  0.139681 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_42123  predicted protein  34.1 
 
 		 343 aa  181  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15627  predicted protein  35.8 
 
 		 315 aa  174  6.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254802  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83187  ubiquitin-protein ligase (E3)  30.03 
 
 		 977 aa  158  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43113  predicted protein  27.88 
 
 		 443 aa  152  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  hitchhiker  0.00922136 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41776  predicted protein  27.59 
 
 		 376 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.282531  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36723  predicted protein  27.59 
 
 		 376 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00193554 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14843  predicted protein  30.71 
 
 		 283 aa  142  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03999  IQ and HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04210)  27.48 
 
 		 1222 aa  140  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_006686  CND03680  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 		 1843 aa  120  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.421578  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01874  HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04450)  34.86 
 
 		 1146 aa  114  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39499  predicted protein  25.49 
 
 		 520 aa  98.2  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00243208 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38506  predicted protein  31.79 
 
 		 192 aa  93.6  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432889  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01746  ubiquitin-protein ligase Ufd4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08880)  24.84 
 
 		 1820 aa  91.3  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0719286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32908  ubiquitin--protein ligase  29.9 
 
 		 1702 aa  87.8  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0606502  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31158  predicted protein  26.09 
 
 		 781 aa  84.7  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000507428  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_52750  ubiquitin-protein ligase 1  29.05 
 
 		 166 aa  79  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32201  predicted protein  44.26 
 
 		 1265 aa  56.6  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0196343  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61977  putative xylanase/chitin deacetylase  34.78 
 
 		 1264 aa  51.2  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49065  predicted protein  26.55 
 
 		 2083 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50498  predicted protein  26.09 
 
 		 682 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03120  transmembrane protein, putative  28.72 
 
 		 1545 aa  45.4  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.147614  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8959  predicted protein  28.87 
 
 		 117 aa  45.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>