33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81688 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_01966  ubiquitin-protein ligase (Tom1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10780)  58.08 
 
 		 4022 aa  781    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81688  E3 ubiquitin protein ligase TOM1 (Temperature dependent-organization in mitotic nucleus protein 1)  100 
 
 		 3268 aa  6733    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.325065 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01260  ubiquitin-protein ligase, putative  34.3 
 
 		 3251 aa  625  1e-177  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41898  predicted protein  43.24 
 
 		 406 aa  377  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52147  predicted protein  43.24 
 
 		 406 aa  377  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00220  ubiquitin-protein ligase, putative  46.56 
 
 		 833 aa  365  8e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.311807  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65602  predicted protein  48.32 
 
 		 776 aa  361  1.9999999999999998e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.62617  normal  0.190036 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12562  predicted protein  43.52 
 
 		 384 aa  349  4e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637847  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01339  ubiquitin-protein ligase (Rsp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09500)  46.52 
 
 		 821 aa  339  7e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14177  predicted protein  36.78 
 
 		 370 aa  261  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.324881  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14345  predicted protein  37.81 
 
 		 367 aa  254  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01540  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1063 aa  224  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83187  ubiquitin-protein ligase (E3)  31.26 
 
 		 977 aa  196  6e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15627  predicted protein  37.27 
 
 		 315 aa  195  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254802  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66630  predicted protein  31.23 
 
 		 950 aa  183  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.214435 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_42123  predicted protein  33.13 
 
 		 343 aa  179  8e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00444  ubiquitin-protein ligase (Hul4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04640)  30.6 
 
 		 1090 aa  165  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358914  normal  0.139681 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43113  predicted protein  31.44 
 
 		 443 aa  162  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  hitchhiker  0.00922136 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41776  predicted protein  30.32 
 
 		 376 aa  160  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.282531  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36723  predicted protein  30.32 
 
 		 376 aa  160  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00193554 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03999  IQ and HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04210)  31.16 
 
 		 1222 aa  152  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14843  predicted protein  30.04 
 
 		 283 aa  141  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03680  conserved hypothetical protein  24.86 
 
 		 1843 aa  107  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.421578  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01746  ubiquitin-protein ligase Ufd4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08880)  28.1 
 
 		 1820 aa  106  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0719286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31158  predicted protein  22.38 
 
 		 781 aa  102  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000507428  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32908  ubiquitin--protein ligase  26.32 
 
 		 1702 aa  102  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0606502  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38506  predicted protein  30.93 
 
 		 192 aa  100  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19169  predicted protein  25.8 
 
 		 3018 aa  100  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17941  predicted protein  25.8 
 
 		 3018 aa  100  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.78771  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01874  HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04450)  29.78 
 
 		 1146 aa  92.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39499  predicted protein  24.18 
 
 		 520 aa  90.5  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00243208 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_52750  ubiquitin-protein ligase 1  28.38 
 
 		 166 aa  72.4  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36043  predicted protein  22.08 
 
 		 3911 aa  53.9  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>