30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14843 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_14843  predicted protein  100 
 
 		 283 aa  578  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01540  hypothetical protein  37.81 
 
 		 1063 aa  193  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_42123  predicted protein  38.87 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41776  predicted protein  34.98 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.282531  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36723  predicted protein  34.98 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00193554 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83187  ubiquitin-protein ligase (E3)  35.31 
 
 		 977 aa  183  4.0000000000000006e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03999  IQ and HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04210)  36.72 
 
 		 1222 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12562  predicted protein  32.38 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637847  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52147  predicted protein  32.03 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41898  predicted protein  32.03 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01260  ubiquitin-protein ligase, putative  33.57 
 
 		 3251 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43113  predicted protein  32.97 
 
 		 443 aa  152  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  hitchhiker  0.00922136 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00220  ubiquitin-protein ligase, putative  32.16 
 
 		 833 aa  151  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.311807  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01966  ubiquitin-protein ligase (Tom1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10780)  30.69 
 
 		 4022 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581639  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01339  ubiquitin-protein ligase (Rsp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09500)  33.57 
 
 		 821 aa  149  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65602  predicted protein  31.07 
 
 		 776 aa  142  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.62617  normal  0.190036 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81688  E3 ubiquitin protein ligase TOM1 (Temperature dependent-organization in mitotic nucleus protein 1)  30.04 
 
 		 3268 aa  141  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.325065 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66630  predicted protein  29.93 
 
 		 950 aa  120  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.214435 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00444  ubiquitin-protein ligase (Hul4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04640)  32.3 
 
 		 1090 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358914  normal  0.139681 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14177  predicted protein  29.72 
 
 		 370 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.324881  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14345  predicted protein  27.4 
 
 		 367 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15627  predicted protein  30.6 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254802  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32908  ubiquitin--protein ligase  32.82 
 
 		 1702 aa  98.2  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0606502  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39499  predicted protein  25.32 
 
 		 520 aa  91.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00243208 
 
 
-
 
NC_006686  CND03680  conserved hypothetical protein  24.83 
 
 		 1843 aa  88.6  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.421578  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01746  ubiquitin-protein ligase Ufd4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08880)  31 
 
 		 1820 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0719286  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01874  HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04450)  30.27 
 
 		 1146 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31158  predicted protein  24.65 
 
 		 781 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000507428  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38506  predicted protein  27.72 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_52750  ubiquitin-protein ligase 1  30.43 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>