30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15627 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_15627  predicted protein  100 
 
 		 315 aa  641    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254802  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00444  ubiquitin-protein ligase (Hul4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04640)  37.99 
 
 		 1090 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358914  normal  0.139681 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66630  predicted protein  38.58 
 
 		 950 aa  197  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.214435 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81688  E3 ubiquitin protein ligase TOM1 (Temperature dependent-organization in mitotic nucleus protein 1)  37.27 
 
 		 3268 aa  196  5.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.325065 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01966  ubiquitin-protein ligase (Tom1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10780)  36.39 
 
 		 4022 aa  189  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581639  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01339  ubiquitin-protein ligase (Rsp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09500)  36.42 
 
 		 821 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41898  predicted protein  35.78 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52147  predicted protein  35.78 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65602  predicted protein  35.8 
 
 		 776 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.62617  normal  0.190036 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01260  ubiquitin-protein ligase, putative  35.08 
 
 		 3251 aa  169  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00220  ubiquitin-protein ligase, putative  34.67 
 
 		 833 aa  168  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.311807  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12562  predicted protein  33.22 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637847  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14345  predicted protein  32.69 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14177  predicted protein  31.58 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.324881  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01540  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1063 aa  139  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_42123  predicted protein  30.86 
 
 		 343 aa  132  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01874  HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04450)  37.06 
 
 		 1146 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36723  predicted protein  29.76 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00193554 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41776  predicted protein  29.76 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.282531  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43113  predicted protein  31.61 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  hitchhiker  0.00922136 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83187  ubiquitin-protein ligase (E3)  30.45 
 
 		 977 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03999  IQ and HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04210)  28.73 
 
 		 1222 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14843  predicted protein  30.6 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01746  ubiquitin-protein ligase Ufd4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08880)  36.02 
 
 		 1820 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0719286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31158  predicted protein  27.67 
 
 		 781 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000507428  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39499  predicted protein  24.83 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00243208 
 
 
-
 
NC_006686  CND03680  conserved hypothetical protein  24.52 
 
 		 1843 aa  75.5  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.421578  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38506  predicted protein  31.91 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32908  ubiquitin--protein ligase  29.19 
 
 		 1702 aa  65.5  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0606502  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_52750  ubiquitin-protein ligase 1  30.71 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>