33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI01260 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_01966  ubiquitin-protein ligase (Tom1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10780)  39.52 
 
 		 4022 aa  743    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581639  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01260  ubiquitin-protein ligase, putative  100 
 
 		 3251 aa  6706    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81688  E3 ubiquitin protein ligase TOM1 (Temperature dependent-organization in mitotic nucleus protein 1)  30.22 
 
 		 3268 aa  711    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.325065 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12562  predicted protein  45.69 
 
 		 384 aa  353  3e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637847  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52147  predicted protein  42.16 
 
 		 406 aa  342  5e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41898  predicted protein  42.16 
 
 		 406 aa  342  5e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00220  ubiquitin-protein ligase, putative  43.73 
 
 		 833 aa  332  9e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.311807  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01339  ubiquitin-protein ligase (Rsp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09500)  42.94 
 
 		 821 aa  327  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65602  predicted protein  42.46 
 
 		 776 aa  327  2e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.62617  normal  0.190036 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14177  predicted protein  34.32 
 
 		 370 aa  211  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.324881  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14345  predicted protein  31.81 
 
 		 367 aa  190  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01540  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1063 aa  186  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36723  predicted protein  32.71 
 
 		 376 aa  176  7.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00193554 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41776  predicted protein  32.71 
 
 		 376 aa  176  7.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.282531  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_42123  predicted protein  32.65 
 
 		 343 aa  174  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66630  predicted protein  32.25 
 
 		 950 aa  174  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.214435 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15627  predicted protein  35.08 
 
 		 315 aa  169  9e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254802  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00444  ubiquitin-protein ligase (Hul4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04640)  30.37 
 
 		 1090 aa  159  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358914  normal  0.139681 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14843  predicted protein  33.57 
 
 		 283 aa  155  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83187  ubiquitin-protein ligase (E3)  28.74 
 
 		 977 aa  148  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43113  predicted protein  29.06 
 
 		 443 aa  139  7.000000000000001e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  hitchhiker  0.00922136 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03999  IQ and HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04210)  30.62 
 
 		 1222 aa  134  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.169282 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01874  HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04450)  34.46 
 
 		 1146 aa  106  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31158  predicted protein  26.26 
 
 		 781 aa  106  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000507428  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03680  conserved hypothetical protein  24.8 
 
 		 1843 aa  105  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.421578  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_52750  ubiquitin-protein ligase 1  38.1 
 
 		 166 aa  101  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39499  predicted protein  28.57 
 
 		 520 aa  101  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00243208 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01746  ubiquitin-protein ligase Ufd4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08880)  24.3 
 
 		 1820 aa  99  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0719286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32908  ubiquitin--protein ligase  26.19 
 
 		 1702 aa  98.2  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0606502  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38506  predicted protein  34.34 
 
 		 192 aa  88.2  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36043  predicted protein  21.18 
 
 		 3911 aa  79  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19169  predicted protein  22.45 
 
 		 3018 aa  65.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17941  predicted protein  22.45 
 
 		 3018 aa  65.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.78771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>