30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_52147 on replicon NC_009375
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009367  OSTLU_41898  predicted protein  100 
 
 		 406 aa  843    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52147  predicted protein  100 
 
 		 406 aa  843    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01966  ubiquitin-protein ligase (Tom1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10780)  48.89 
 
 		 4022 aa  412  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12562  predicted protein  49.74 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637847  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81688  E3 ubiquitin protein ligase TOM1 (Temperature dependent-organization in mitotic nucleus protein 1)  43.24 
 
 		 3268 aa  376  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.325065 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01260  ubiquitin-protein ligase, putative  42.16 
 
 		 3251 aa  331  1e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65602  predicted protein  42.21 
 
 		 776 aa  314  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.62617  normal  0.190036 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00220  ubiquitin-protein ligase, putative  42.21 
 
 		 833 aa  306  3e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.311807  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01339  ubiquitin-protein ligase (Rsp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09500)  42.21 
 
 		 821 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14345  predicted protein  38.95 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14177  predicted protein  37.15 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.324881  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_42123  predicted protein  40.67 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01540  hypothetical protein  32.85 
 
 		 1063 aa  192  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66630  predicted protein  31.96 
 
 		 950 aa  190  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.214435 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36723  predicted protein  32.09 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00193554 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41776  predicted protein  32.09 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.282531  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15627  predicted protein  35.78 
 
 		 315 aa  176  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254802  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00444  ubiquitin-protein ligase (Hul4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04640)  31.47 
 
 		 1090 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358914  normal  0.139681 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03999  IQ and HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04210)  31.7 
 
 		 1222 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83187  ubiquitin-protein ligase (E3)  29.03 
 
 		 977 aa  164  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14843  predicted protein  32.03 
 
 		 283 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43113  predicted protein  26.94 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  hitchhiker  0.00922136 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31158  predicted protein  28.66 
 
 		 781 aa  127  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000507428  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32908  ubiquitin--protein ligase  29.77 
 
 		 1702 aa  103  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0606502  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39499  predicted protein  25.62 
 
 		 520 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00243208 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01874  HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04450)  31.25 
 
 		 1146 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38506  predicted protein  31.96 
 
 		 192 aa  98.6  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432889  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03680  conserved hypothetical protein  24.12 
 
 		 1843 aa  93.2  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.421578  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_52750  ubiquitin-protein ligase 1  33.1 
 
 		 166 aa  90.9  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01746  ubiquitin-protein ligase Ufd4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08880)  26.6 
 
 		 1820 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0719286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>