30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ01540 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ01540  hypothetical protein  100 
 
 		 1063 aa  2180    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03999  IQ and HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04210)  38.35 
 
 		 1222 aa  344  5.999999999999999e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83187  ubiquitin-protein ligase (E3)  32.36 
 
 		 977 aa  291  5.0000000000000004e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41776  predicted protein  40.58 
 
 		 376 aa  271  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.282531  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36723  predicted protein  40.58 
 
 		 376 aa  271  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00193554 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43113  predicted protein  37.14 
 
 		 443 aa  270  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  hitchhiker  0.00922136 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_42123  predicted protein  41.98 
 
 		 343 aa  257  6e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81688  E3 ubiquitin protein ligase TOM1 (Temperature dependent-organization in mitotic nucleus protein 1)  31.09 
 
 		 3268 aa  225  4e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.325065 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12562  predicted protein  36.31 
 
 		 384 aa  212  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637847  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01339  ubiquitin-protein ligase (Rsp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09500)  37.15 
 
 		 821 aa  208  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01966  ubiquitin-protein ligase (Tom1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10780)  35.1 
 
 		 4022 aa  208  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65602  predicted protein  33.99 
 
 		 776 aa  206  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.62617  normal  0.190036 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00220  ubiquitin-protein ligase, putative  35.38 
 
 		 833 aa  202  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.311807  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14843  predicted protein  37.81 
 
 		 283 aa  192  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52147  predicted protein  32.85 
 
 		 406 aa  191  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41898  predicted protein  32.85 
 
 		 406 aa  191  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01260  ubiquitin-protein ligase, putative  33.7 
 
 		 3251 aa  187  9e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14345  predicted protein  32.7 
 
 		 367 aa  169  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66630  predicted protein  31.77 
 
 		 950 aa  159  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.214435 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00444  ubiquitin-protein ligase (Hul4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04640)  31 
 
 		 1090 aa  151  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358914  normal  0.139681 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14177  predicted protein  30.6 
 
 		 370 aa  150  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.324881  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15627  predicted protein  30.03 
 
 		 315 aa  139  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254802  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32908  ubiquitin--protein ligase  29.02 
 
 		 1702 aa  129  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0606502  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39499  predicted protein  25 
 
 		 520 aa  121  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00243208 
 
 
-
 
NC_006686  CND03680  conserved hypothetical protein  23.59 
 
 		 1843 aa  115  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.421578  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01746  ubiquitin-protein ligase Ufd4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08880)  26.52 
 
 		 1820 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0719286  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01874  HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04450)  31.79 
 
 		 1146 aa  90.9  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31158  predicted protein  24.29 
 
 		 781 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000507428  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38506  predicted protein  30.26 
 
 		 192 aa  76.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_52750  ubiquitin-protein ligase 1  33.1 
 
 		 166 aa  63.9  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>