17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61977 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_61977  putative xylanase/chitin deacetylase  100 
 
 
1264 aa  2574    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674296  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09149  membrane bound C2 domain protein (vp115), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01840)  30.89 
 
 
1506 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0327792  normal  0.0431672 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68263  hypothetical protein putative xylanase/chitin deacetylase  31.19 
 
 
1191 aa  449  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03120  transmembrane protein, putative  36.32 
 
 
1545 aa  432  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.147614  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27675  predicted protein  26.16 
 
 
852 aa  86.7  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05624  C2 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G11110)  24.07 
 
 
1237 aa  82  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00865536 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09079  C2 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G02350)  31.62 
 
 
1343 aa  62.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.220408  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8959  predicted protein  34 
 
 
117 aa  60.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03390  conserved hypothetical protein  21.59 
 
 
1345 aa  59.3  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33544  predicted protein  20 
 
 
880 aa  57  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177356  normal  0.0121909 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05040  conserved hypothetical protein  19.81 
 
 
1136 aa  57.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0208091  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9049  predicted protein  30.33 
 
 
123 aa  52.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0977102  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119597  synaptotagmin, Ca2+-dependent lipid-binding protein, putative  22.97 
 
 
578 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175619  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25388  predicted protein  19.63 
 
 
1811 aa  49.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.064672  hitchhiker  0.000756459 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_17956  predicted protein  30.91 
 
 
547 aa  48.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28884  predicted protein  22.57 
 
 
928 aa  47  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.433632  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  28.87 
 
 
1264 aa  45.4  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>