84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21794 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_21794  predicted protein  100 
 
 		 346 aa  720    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49403  predicted protein  62.9 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.220793  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01695  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G08530)  37.66 
 
 		 609 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.416154  normal  0.0260007 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81872  predicted protein  32.43 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01560  transparent testa glabra 1 protein (ttg1 protein), putative  36.56 
 
 		 418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  22.81 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  25.88 
 
 		 466 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  26.18 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.44 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.76 
 
 		 1831 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.62 
 
 		 924 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.31 
 
 		 1344 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.77 
 
 		 757 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  25.31 
 
 		 432 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04518  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03080)  24.48 
 
 		 1289 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.98 
 
 		 828 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.34 
 
 		 1217 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1041 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  24.74 
 
 		 516 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  24.1 
 
 		 489 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  30.14 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.81 
 
 		 1357 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47010  predicted protein  24.16 
 
 		 1133 aa  50.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.671968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.08 
 
 		 943 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  22.46 
 
 		 1491 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.17 
 
 		 1686 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  24.68 
 
 		 1443 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00880  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 7 (Eurofung)  25.59 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00230  U5 snRNP-specific 40 kDa protein, putative  22.22 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.718611  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.49 
 
 		 1411 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3024  predicted protein  24.82 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.575089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.11 
 
 		 1652 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81799  substrate-specific activator of APC-dependent proteolysis  24.7 
 
 		 592 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0740559  normal  0.327492 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 		 1878 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1304 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  22.5 
 
 		 1188 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.9 
 
 		 1039 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  26.04 
 
 		 402 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61538  histone acetyltransferase subunit  26.81 
 
 		 397 aa  46.6  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.204154 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01468  pre-mRNA splicing factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04590)  35.37 
 
 		 521 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559626  hitchhiker  0.00529797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.73 
 
 		 1240 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 1221 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21897  G protein beta subunit  28.41 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173476  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00630  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  34.62 
 
 		 870 aa  46.2  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31740  predicted protein  21.67 
 
 		 458 aa  46.2  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.11 
 
 		 1623 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  26.67 
 
 		 492 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1807 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1209 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  21.4 
 
 		 1424 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1474 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.63 
 
 		 898 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  25.46 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39452  predicted protein  24.89 
 
 		 1077 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2440  WD-40 repeat-containing protein  29.93 
 
 		 433 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00410064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1553 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.83 
 
 		 1193 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.63 
 
 		 865 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1367 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1477 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.32 
 
 		 596 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54743  predicted protein  20.95 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0297675  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_2648  predicted protein  24.76 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.58 
 
 		 1599 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  34.92 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  23.31 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.78 
 
 		 676 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  28.66 
 
 		 1901 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.44 
 
 		 740 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.97 
 
 		 682 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  24.85 
 
 		 564 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  25 
 
 		 618 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.6 
 
 		 1229 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45580  coronin like protein  24.12 
 
 		 450 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28694  predicted protein  23.27 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.68 
 
 		 1262 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1657 aa  43.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  27.73 
 
 		 1247 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.62 
 
 		 698 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.28 
 
 		 696 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.34 
 
 		 729 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  32.43 
 
 		 1097 aa  42.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  24.68 
 
 		 342 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1427 aa  42.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>