61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01560 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF01560  transparent testa glabra 1 protein (ttg1 protein), putative  100 
 
 		 418 aa  857    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01695  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G08530)  36.16 
 
 		 609 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.416154  normal  0.0260007 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21794  predicted protein  36.56 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49403  predicted protein  32.73 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.220793  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81872  predicted protein  28.03 
 
 		 448 aa  156  8e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17027  predicted protein  25.61 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.625475  normal  0.0184587 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  26.23 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  25.41 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.06 
 
 		 1831 aa  56.6  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  26.28 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  25.27 
 
 		 466 aa  53.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1211 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1491 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04648  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit Utp15, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01780)  25.19 
 
 		 541 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  24.5 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06160  Polyadenylation factor subunit 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZX0]  23.61 
 
 		 567 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  28.3 
 
 		 316 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  25.14 
 
 		 317 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3024  predicted protein  25.29 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.575089  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  26.83 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.73 
 
 		 596 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61538  histone acetyltransferase subunit  25.28 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  27.78 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 1221 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01430  chromatin binding protein, putative  27.66 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.66 
 
 		 1240 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.51 
 
 		 828 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31512  predicted protein  23.03 
 
 		 538 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 1443 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21897  G protein beta subunit  26.61 
 
 		 351 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173476  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.75 
 
 		 1652 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.85 
 
 		 1262 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  24.39 
 
 		 316 aa  47  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00081  G-protein beta subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74214]  27.21 
 
 		 352 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  28.74 
 
 		 1901 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  23.81 
 
 		 316 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.43 
 
 		 618 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  23.87 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01430  conserved hypothetical protein  26.62 
 
 		 712 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08183  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (Pwp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03090)  24.63 
 
 		 851 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559435  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  22.53 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.11 
 
 		 1557 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.38 
 
 		 1357 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00630  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  34.67 
 
 		 870 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04226  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (SOF1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06290)  26.29 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43856  predicted protein  25.16 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.796398 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02070  trp-asp repeats containing protein, putative  28.18 
 
 		 757 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07530  57.7 kda trp-asp repeats containing protein, putative  25.13 
 
 		 523 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585793  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  33.33 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  21.68 
 
 		 947 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00292  transcription initiation factor TFIID subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03070)  26.11 
 
 		 606 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00299159  normal  0.644069 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02965  cell cycle regulatory protein (Srw1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08280)  22.62 
 
 		 592 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.76845 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00880  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 7 (Eurofung)  25.93 
 
 		 355 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01220  cytoplasm protein, putative  24.03 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.24 
 
 		 642 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  23.16 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03830  conserved hypothetical protein  26.12 
 
 		 343 aa  43.5  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2440  WD-40 repeat-containing protein  30.52 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00410064  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40760  subunit of histone acetyltransferase  23.42 
 
 		 402 aa  43.1  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500001  normal  0.43958 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09085  U5 snRNP complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02280)  26.39 
 
 		 359 aa  43.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.09 
 
 		 742 aa  43.1  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>