More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01220 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK01220  cytoplasm protein, putative  100 
 
 
391 aa  797    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01056  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12380)  29.01 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.691814  decreased coverage  0.00696515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.36 
 
 
930 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.04 
 
 
1652 aa  99.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  29.66 
 
 
1363 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.15 
 
 
1236 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  27.5 
 
 
1523 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  26.09 
 
 
1247 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  29.26 
 
 
1901 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.19 
 
 
1868 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.59 
 
 
1474 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  30.37 
 
 
696 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  25.77 
 
 
1454 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  28.07 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.37 
 
 
1163 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  24.83 
 
 
589 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
1557 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  26.87 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.06 
 
 
742 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00630  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  27.07 
 
 
870 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  27.05 
 
 
577 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  26.7 
 
 
1416 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.47 
 
 
630 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.67 
 
 
1364 aa  73.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.43 
 
 
947 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  25.16 
 
 
657 aa  73.6  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  23.18 
 
 
728 aa  73.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.13 
 
 
1188 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  25.56 
 
 
473 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5471  predicted protein  24.92 
 
 
264 aa  72.8  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.22 
 
 
1760 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  29.23 
 
 
1443 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  25.72 
 
 
782 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  33.74 
 
 
774 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.64 
 
 
1196 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.2 
 
 
1831 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  26.23 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.55 
 
 
1221 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25.95 
 
 
1807 aa  70.5  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.71 
 
 
1193 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.94 
 
 
1039 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.4 
 
 
1208 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  27.2 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.04 
 
 
1481 aa  70.1  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.85 
 
 
1367 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.77 
 
 
1686 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.11 
 
 
1262 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  24.83 
 
 
518 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02050  sulfur metabolite repression control protein, putative  26.16 
 
 
861 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  23.76 
 
 
928 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.36 
 
 
1240 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.28 
 
 
1510 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.46 
 
 
677 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  32.29 
 
 
1041 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  28.9 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.17 
 
 
1357 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.68 
 
 
1856 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.03 
 
 
692 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.16 
 
 
1211 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.05 
 
 
1217 aa  66.2  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.03 
 
 
1188 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  26.56 
 
 
1190 aa  66.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56432  predicted protein  28.4 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491701  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  26.83 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.07 
 
 
740 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  25 
 
 
678 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  24.84 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  24.18 
 
 
1878 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.49 
 
 
1607 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.61 
 
 
1214 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  24.72 
 
 
452 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  22.67 
 
 
1213 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  24.18 
 
 
324 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.13 
 
 
1623 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  37.9 
 
 
954 aa  63.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.17 
 
 
676 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.03 
 
 
682 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_12918  predicted protein  29.14 
 
 
304 aa  63.2  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.393166 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  30.05 
 
 
335 aa  63.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  25.83 
 
 
813 aa  63.2  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  23.92 
 
 
464 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.31 
 
 
1164 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.68 
 
 
664 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  30.52 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30.77 
 
 
1484 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.15 
 
 
576 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  25.79 
 
 
772 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21929  predicted protein  25.99 
 
 
1270 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.48 
 
 
596 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.06 
 
 
1553 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  25.79 
 
 
772 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83827  predicted protein  24.73 
 
 
789 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0497188  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  24.58 
 
 
522 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.29 
 
 
792 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  38.71 
 
 
589 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29038  predicted protein  39.24 
 
 
1281 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.985695  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  23.24 
 
 
316 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  26.39 
 
 
367 aa  60.1  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.38 
 
 
698 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  21.99 
 
 
578 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>