239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45580 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45580  coronin like protein  100 
 
 
450 aa  939    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06341  putative coronin homolog (Eurofung)  33.83 
 
 
611 aa  259  5.0000000000000005e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.592518  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03300  microtubule binding protein, putative  33.64 
 
 
694 aa  246  6.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  27.95 
 
 
1320 aa  139  7.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  29.23 
 
 
1163 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.1 
 
 
1652 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.37 
 
 
1262 aa  71.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.37 
 
 
1552 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.32 
 
 
1236 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.29 
 
 
1363 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.14 
 
 
1686 aa  70.5  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  27.49 
 
 
1247 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 
947 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.05 
 
 
676 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.13 
 
 
1357 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  25.11 
 
 
443 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.91 
 
 
1221 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  22.86 
 
 
1831 aa  66.6  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.1 
 
 
1443 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03960  WD-repeat protein, putative  24.47 
 
 
622 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.44 
 
 
682 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  22.84 
 
 
1196 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.92 
 
 
657 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  24.71 
 
 
1214 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  26.36 
 
 
1190 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17027  predicted protein  27.22 
 
 
500 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.625475  normal  0.0184587 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  29.38 
 
 
484 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.43 
 
 
1364 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
1711 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.67 
 
 
630 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27 
 
 
1217 aa  64.7  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  23.28 
 
 
434 aa  63.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.85 
 
 
1523 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.05 
 
 
740 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.86 
 
 
1474 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.41 
 
 
919 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.35 
 
 
696 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  23.75 
 
 
1209 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  24.85 
 
 
1344 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.15 
 
 
1188 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.46 
 
 
1789 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  24.74 
 
 
316 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  26.5 
 
 
1209 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.94 
 
 
1411 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.46 
 
 
865 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  22.73 
 
 
782 aa  60.1  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05196  mRNA splicing factor (Prp17), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07300)  25 
 
 
531 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202062  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 
618 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02290  pre-mRNA splicing factor, putative  25.27 
 
 
615 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.6 
 
 
692 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.71 
 
 
1607 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.61 
 
 
1760 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  24.88 
 
 
1208 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  27.81 
 
 
324 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  25.76 
 
 
1553 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.4 
 
 
1213 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06867  Mitochondrial division protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXW3]  25.42 
 
 
654 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  0.183492 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00081  G-protein beta subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74214]  25.52 
 
 
352 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  22.91 
 
 
466 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.27 
 
 
677 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  22.27 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  25.91 
 
 
511 aa  57.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  25.26 
 
 
335 aa  57.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  25.52 
 
 
316 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25.84 
 
 
742 aa  57.4  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.06 
 
 
716 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  24.4 
 
 
435 aa  57.4  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.13 
 
 
833 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  30.71 
 
 
522 aa  56.6  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  26.67 
 
 
790 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 
687 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.62 
 
 
1609 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.09 
 
 
737 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  24.18 
 
 
511 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.48 
 
 
828 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.53 
 
 
1004 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.67 
 
 
1193 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  25.27 
 
 
577 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.05 
 
 
1161 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.83 
 
 
1039 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  26.74 
 
 
344 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.44 
 
 
642 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  20.7 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37533  predicted protein  23.14 
 
 
485 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  26.2 
 
 
344 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.05 
 
 
1161 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.41 
 
 
1267 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28694  predicted protein  24.47 
 
 
316 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  29.21 
 
 
954 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  28.12 
 
 
439 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01430  conserved hypothetical protein  25.68 
 
 
712 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.8 
 
 
1599 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  25.55 
 
 
840 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.5 
 
 
1510 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.61 
 
 
1557 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  26.94 
 
 
495 aa  53.9  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  22.59 
 
 
1454 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  22.02 
 
 
924 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  22.28 
 
 
516 aa  53.5  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23077  predicted protein  26.79 
 
 
379 aa  53.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>