More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03960 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB03960  WD-repeat protein, putative  100 
 
 
622 aa  1275    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  31.87 
 
 
1474 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  36.22 
 
 
696 aa  150  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  34.47 
 
 
1868 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  32.99 
 
 
1221 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  32.94 
 
 
1523 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  31.05 
 
 
1363 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.88 
 
 
1652 aa  138  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  34.65 
 
 
947 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  31.21 
 
 
1196 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  28.7 
 
 
1193 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.91 
 
 
1188 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.65 
 
 
676 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  32.94 
 
 
1163 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  31.33 
 
 
1901 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
1831 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  32.02 
 
 
1236 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.97 
 
 
1686 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.37 
 
 
677 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.37 
 
 
1240 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.16 
 
 
1454 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  30.86 
 
 
1789 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  33.65 
 
 
1190 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.22 
 
 
682 aa  125  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  30.24 
 
 
1364 aa  123  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  31.92 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  32.8 
 
 
1443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 
1557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  30.22 
 
 
443 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.68 
 
 
692 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  31.6 
 
 
742 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.98 
 
 
1807 aa  120  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.87 
 
 
630 aa  120  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.24 
 
 
596 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  29.17 
 
 
1161 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.17 
 
 
1161 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  34.45 
 
 
1247 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.88 
 
 
1760 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.07 
 
 
792 aa  117  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  28.91 
 
 
1416 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  34.26 
 
 
1211 aa  114  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.2 
 
 
1547 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  32.47 
 
 
1553 aa  114  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.2 
 
 
1609 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  31.33 
 
 
1510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  27.8 
 
 
1214 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  30.5 
 
 
316 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.86 
 
 
434 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.79 
 
 
1213 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  30.56 
 
 
1552 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.85 
 
 
1598 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.09 
 
 
1188 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  26.73 
 
 
317 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.69 
 
 
1607 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  35.53 
 
 
618 aa  110  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.824291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.33 
 
 
1481 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  35.75 
 
 
954 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.34 
 
 
1262 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  27.21 
 
 
316 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  31.6 
 
 
1242 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  32.03 
 
 
790 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  30.34 
 
 
840 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.24 
 
 
1684 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.41 
 
 
1164 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  26.44 
 
 
564 aa  107  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.49 
 
 
576 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  29.27 
 
 
617 aa  107  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.86 
 
 
740 aa  107  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.81 
 
 
664 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.88 
 
 
1856 aa  107  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.69 
 
 
930 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  26.25 
 
 
687 aa  106  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  30.7 
 
 
928 aa  107  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 
1229 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.08 
 
 
1357 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.81 
 
 
574 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  29.75 
 
 
316 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.06 
 
 
1267 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 
1711 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.25 
 
 
1626 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  34.1 
 
 
1858 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.44 
 
 
1583 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  29.15 
 
 
872 aa  104  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.07 
 
 
1599 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  27.89 
 
 
1878 aa  104  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  26.09 
 
 
657 aa  104  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.58 
 
 
1623 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  30.93 
 
 
505 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  35.98 
 
 
1176 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  32.21 
 
 
782 aa  103  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  30.28 
 
 
1411 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  30.21 
 
 
540 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.99 
 
 
1617 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.61 
 
 
1398 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  23.44 
 
 
589 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.6 
 
 
464 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  28.52 
 
 
1599 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  28.83 
 
 
1330 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.76 
 
 
733 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  30.5 
 
 
577 aa  100  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>